Metabolic analyses of interspecific tomato recombinant inbred lines for fruit quality improvement
- Autores
- Lopez, Mariana Gabriela; Zanor, María Inés; Pratta, Guillermo Raúl; Stegmayer, Georgina; Boggio, Silvana Beatriz; Conte, Mariana; Bermudez Salazar, Luisa; Coluccio Leskow, Carla; Rodríguez, Gustavo Rubén; Picardi, Liliana Amelia; Zorzoli, Roxana; Fernie, Alisdair R.; Milone, Diego Humberto; Asis, Ramón; Valle, Estela Marta; Carrari, Fernando
- Año de publicación
- 2015
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Elucidating the determinants of tomato nutritional value and fruit quality to introduce improved varieties on the international market represents a major challenge for crop biotechnology. Different strategies can be undertaken to exploit the natural variability of Solanum to re-incorporate lost allelic diversity into commercial varieties. One of them is the characterization of selected germplasm for breeding programs. To achieve this goal, 18 RILs (S. lycopersicum × S. pimpinellifolium) were comprehensively phenotyped for fruit polar metabolites and quality associated traits. Metabolites were quantified by GC–MS and 1H NMR. Integrative analyses by neuronal clustering and network construction revealed that fruit properties are strongly associated with the metabolites aspartate, serine, glutamate and 2-oxoglutarate. Shelf life and firmness appeared to be linked to malate content. By a comparative analysis of the whole data set, ten RILs presented higher number of traits with positive effect than the S. lycopersicum × S. pimpinellifolium hybrid. Thus, these lines can be proposed as promising candidates for breeding programs aimed to improve fruit quality.
Instituto de Biotecnología
Fil: Lopez, Mariana Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Zanor, María Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; Argentina
Fil: Stegmayer, Georgina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional. Centro de Investigación en Ingeniería en Sistemas de Información; Argentina
Fil: Boggio, Silvana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Conte, Mariana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Bermudez Salazar, Luisa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Coluccio Leskow, Carla. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Rodríguez, Gustavo Rubén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; Argentina
Fil: Picardi, Liliana Amelia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; Argentina
Fil: Zorzoli, Roxana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; Argentina
Fil: Fernie, Alisdair R. Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology; Alemania
Fil: Milone, Diego Humberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ingeniería y Ciencias Hídricas. Departamento de Informática. Laboratorio de Investigaciones en Señales e Inteligencia Computacional; Argentina
Fil: Asis, Ramón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Córdoba. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentina
Fil: Valle, Estela Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Carrari, Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina - Fuente
- Metabolomics 11 (5) : 1416–1431 (October 2015)
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To achieve this goal, 18 RILs (S. lycopersicum × S. pimpinellifolium) were comprehensively phenotyped for fruit polar metabolites and quality associated traits. Metabolites were quantified by GC–MS and 1H NMR. Integrative analyses by neuronal clustering and network construction revealed that fruit properties are strongly associated with the metabolites aspartate, serine, glutamate and 2-oxoglutarate. Shelf life and firmness appeared to be linked to malate content. By a comparative analysis of the whole data set, ten RILs presented higher number of traits with positive effect than the S. lycopersicum × S. pimpinellifolium hybrid. Thus, these lines can be proposed as promising candidates for breeding programs aimed to improve fruit quality.Instituto de BiotecnologíaFil: Lopez, Mariana Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Zanor, María Inés. 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Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Conte, Mariana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Bermudez Salazar, Luisa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Coluccio Leskow, Carla. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rodríguez, Gustavo Rubén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; ArgentinaFil: Picardi, Liliana Amelia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; ArgentinaFil: Zorzoli, Roxana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; ArgentinaFil: Fernie, Alisdair R. Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology; AlemaniaFil: Milone, Diego Humberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ingeniería y Ciencias Hídricas. Departamento de Informática. Laboratorio de Investigaciones en Señales e Inteligencia Computacional; ArgentinaFil: Asis, Ramón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Córdoba. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; ArgentinaFil: Valle, Estela Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. 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