"MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"

Autores
Boeri, Eduardo Jorge; Becker, Paula; Akiyama, Silvia Noemi; Dominguez, María Luz; Elena, Sebastián; Fernandez, Natalia Mercedes; Ruybal, Paula; Escobar, Gabriela Ileana; Hasan, Deborah Beatriz; Trangoni, Marcos David
Año de publicación
2026
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Canine brucellosis, caused by Brucella canis, is a globally significant zoonosis. This study characterized the genetic diversity of B. canis in Argentina and South America using the MLVA_16 scheme, comparing 110 Latin American strains with 84 Asian strains (from Korea and China). The analysis revealed high overall diversity (Hunter-Gaston Index: 0.97) and marked geographical structuring. Using LASSO logistic regression, we identified a minimal panel of five markers (MLVA-5: BRUCE19, BRUCE18, BRUCE11, BRUCE07, BRUCE16) that optimally preserves the phylogeographic signal on a global scale. This optimized scheme, unlike hypervariable markers, proves robust and efficient for conducting traceability studies and determining the geographical origin of B. canis strains, thus offering an ideal balance between discriminatory power and evolutionary resolution.
Instituto de Biotecnología
Fil: Boeri, Eduardo Jorge. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Becker, Paula. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Akiyama, Silvia Noemi. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Dominguez, María Luz. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Elena, Sebastián. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria. Dirección General de Laboratorio y Control Técnico; Argentina
Fil: Fernandez, Natalia Mercedes. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Ruybal, Paula. Hospital Italiano de Buenos Aires. Universidad Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional e Ingeniería Biomédica; Argentina
Fil: Ruybal, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Escobar, Gabriela Ileana. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud Dr. Carlos Malbrán (ANLIS). Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Brucelosis Laboratorio Nacional de Referencia; Argentina
Fil: Hasan, Deborah Beatriz. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud Dr. Carlos Malbrán (ANLIS). Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Brucelosis Laboratorio Nacional de Referencia; Argentina
Fil: Trangoni, Marcos David. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Laboratorio de Brucella, Campylobacter y Microbiota del rumen; Argentina
Fil: Trangoni, Marcos David. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fuente
Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases 126 : 102441 (March 2026)
Materia
Brucella canis
Phylogeography
Epidemiology
Brucellosis
Filogeografía
Epidemiología
Brucelosis
Argentina
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
oai:localhost:20.500.12123/26355

id INTADig_2b4a3bbb0a4ab21338fa6473bc2e7810
oai_identifier_str oai:localhost:20.500.12123/26355
network_acronym_str INTADig
repository_id_str l
network_name_str INTA Digital (INTA)
spelling "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"Boeri, Eduardo JorgeBecker, PaulaAkiyama, Silvia NoemiDominguez, María LuzElena, SebastiánFernandez, Natalia MercedesRuybal, PaulaEscobar, Gabriela IleanaHasan, Deborah BeatrizTrangoni, Marcos DavidBrucella canisPhylogeographyEpidemiologyBrucellosisFilogeografíaEpidemiologíaBrucelosisArgentinaCanine brucellosis, caused by Brucella canis, is a globally significant zoonosis. This study characterized the genetic diversity of B. canis in Argentina and South America using the MLVA_16 scheme, comparing 110 Latin American strains with 84 Asian strains (from Korea and China). The analysis revealed high overall diversity (Hunter-Gaston Index: 0.97) and marked geographical structuring. Using LASSO logistic regression, we identified a minimal panel of five markers (MLVA-5: BRUCE19, BRUCE18, BRUCE11, BRUCE07, BRUCE16) that optimally preserves the phylogeographic signal on a global scale. This optimized scheme, unlike hypervariable markers, proves robust and efficient for conducting traceability studies and determining the geographical origin of B. canis strains, thus offering an ideal balance between discriminatory power and evolutionary resolution.Instituto de BiotecnologíaFil: Boeri, Eduardo Jorge. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; ArgentinaFil: Becker, Paula. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; ArgentinaFil: Akiyama, Silvia Noemi. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; ArgentinaFil: Dominguez, María Luz. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; ArgentinaFil: Elena, Sebastián. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria. Dirección General de Laboratorio y Control Técnico; ArgentinaFil: Fernandez, Natalia Mercedes. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; ArgentinaFil: Ruybal, Paula. Hospital Italiano de Buenos Aires. Universidad Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional e Ingeniería Biomédica; ArgentinaFil: Ruybal, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Escobar, Gabriela Ileana. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud Dr. Carlos Malbrán (ANLIS). Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Brucelosis Laboratorio Nacional de Referencia; ArgentinaFil: Hasan, Deborah Beatriz. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud Dr. Carlos Malbrán (ANLIS). Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Brucelosis Laboratorio Nacional de Referencia; ArgentinaFil: Trangoni, Marcos David. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Laboratorio de Brucella, Campylobacter y Microbiota del rumen; ArgentinaFil: Trangoni, Marcos David. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaElsevier2026-05-26T13:15:43Z2026-05-26T13:15:43Z2026-03info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/26355https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S01479571260000321878-1667https://doi.org/10.1016/j.cimid.2026.102441Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases 126 : 102441 (March 2026)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/restrictedAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)2026-06-04T09:46:25Zoai:localhost:20.500.12123/26355instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2026-06-04 09:46:25.51INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
dc.title.none.fl_str_mv "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
title "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
spellingShingle "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
Boeri, Eduardo Jorge
Brucella canis
Phylogeography
Epidemiology
Brucellosis
Filogeografía
Epidemiología
Brucelosis
Argentina
title_short "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
title_full "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
title_fullStr "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
title_full_unstemmed "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
title_sort "MLVA_5 : A reduced marker scheme for phylogeographic analysis of Brucella canis"
dc.creator.none.fl_str_mv Boeri, Eduardo Jorge
Becker, Paula
Akiyama, Silvia Noemi
Dominguez, María Luz
Elena, Sebastián
Fernandez, Natalia Mercedes
Ruybal, Paula
Escobar, Gabriela Ileana
Hasan, Deborah Beatriz
Trangoni, Marcos David
author Boeri, Eduardo Jorge
author_facet Boeri, Eduardo Jorge
Becker, Paula
Akiyama, Silvia Noemi
Dominguez, María Luz
Elena, Sebastián
Fernandez, Natalia Mercedes
Ruybal, Paula
Escobar, Gabriela Ileana
Hasan, Deborah Beatriz
Trangoni, Marcos David
author_role author
author2 Becker, Paula
Akiyama, Silvia Noemi
Dominguez, María Luz
Elena, Sebastián
Fernandez, Natalia Mercedes
Ruybal, Paula
Escobar, Gabriela Ileana
Hasan, Deborah Beatriz
Trangoni, Marcos David
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Brucella canis
Phylogeography
Epidemiology
Brucellosis
Filogeografía
Epidemiología
Brucelosis
Argentina
topic Brucella canis
Phylogeography
Epidemiology
Brucellosis
Filogeografía
Epidemiología
Brucelosis
Argentina
dc.description.none.fl_txt_mv Canine brucellosis, caused by Brucella canis, is a globally significant zoonosis. This study characterized the genetic diversity of B. canis in Argentina and South America using the MLVA_16 scheme, comparing 110 Latin American strains with 84 Asian strains (from Korea and China). The analysis revealed high overall diversity (Hunter-Gaston Index: 0.97) and marked geographical structuring. Using LASSO logistic regression, we identified a minimal panel of five markers (MLVA-5: BRUCE19, BRUCE18, BRUCE11, BRUCE07, BRUCE16) that optimally preserves the phylogeographic signal on a global scale. This optimized scheme, unlike hypervariable markers, proves robust and efficient for conducting traceability studies and determining the geographical origin of B. canis strains, thus offering an ideal balance between discriminatory power and evolutionary resolution.
Instituto de Biotecnología
Fil: Boeri, Eduardo Jorge. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Becker, Paula. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Akiyama, Silvia Noemi. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Dominguez, María Luz. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Elena, Sebastián. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria. Dirección General de Laboratorio y Control Técnico; Argentina
Fil: Fernandez, Natalia Mercedes. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. División Inmunología y Diagnóstico. Laboratorio Sección Serología y Diagnóstico; Argentina
Fil: Ruybal, Paula. Hospital Italiano de Buenos Aires. Universidad Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional e Ingeniería Biomédica; Argentina
Fil: Ruybal, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Escobar, Gabriela Ileana. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud Dr. Carlos Malbrán (ANLIS). Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Brucelosis Laboratorio Nacional de Referencia; Argentina
Fil: Hasan, Deborah Beatriz. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud Dr. Carlos Malbrán (ANLIS). Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Laboratorio de Brucelosis Laboratorio Nacional de Referencia; Argentina
Fil: Trangoni, Marcos David. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Laboratorio de Brucella, Campylobacter y Microbiota del rumen; Argentina
Fil: Trangoni, Marcos David. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
description Canine brucellosis, caused by Brucella canis, is a globally significant zoonosis. This study characterized the genetic diversity of B. canis in Argentina and South America using the MLVA_16 scheme, comparing 110 Latin American strains with 84 Asian strains (from Korea and China). The analysis revealed high overall diversity (Hunter-Gaston Index: 0.97) and marked geographical structuring. Using LASSO logistic regression, we identified a minimal panel of five markers (MLVA-5: BRUCE19, BRUCE18, BRUCE11, BRUCE07, BRUCE16) that optimally preserves the phylogeographic signal on a global scale. This optimized scheme, unlike hypervariable markers, proves robust and efficient for conducting traceability studies and determining the geographical origin of B. canis strains, thus offering an ideal balance between discriminatory power and evolutionary resolution.
publishDate 2026
dc.date.none.fl_str_mv 2026-05-26T13:15:43Z
2026-05-26T13:15:43Z
2026-03
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12123/26355
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0147957126000032
1878-1667
https://doi.org/10.1016/j.cimid.2026.102441
url http://hdl.handle.net/20.500.12123/26355
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0147957126000032
https://doi.org/10.1016/j.cimid.2026.102441
identifier_str_mv 1878-1667
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
eu_rights_str_mv restrictedAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Elsevier
publisher.none.fl_str_mv Elsevier
dc.source.none.fl_str_mv Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases 126 : 102441 (March 2026)
reponame:INTA Digital (INTA)
instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
reponame_str INTA Digital (INTA)
collection INTA Digital (INTA)
instname_str Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.name.fl_str_mv INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.mail.fl_str_mv tripaldi.nicolas@inta.gob.ar
_version_ 1867091751967129600
score 12.832306