Fruit metabolic and transcriptional programs differentiate among Andean tomato (Solanum lycopersicum L.) accessions

Autores
D’Angelo, Matilde; Zanor, María Inés; Burgos, Estanislao; Asprelli, Pablo Diego; Boggio, Silvana Beatriz; Carrari, Fernando; Peralta, Iris Edith; Valle, Estela M.
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Traditional landraces or “criollo” tomatoes (Solanum lycopersicum L.) from Andean areas of Argentina, selected for their fruit quality, were analysed in this study. We explored the metabolome and transcriptome of the ripe fruit in nine landrace accessions representing the seven genetic groups and compared them to the mature fruit of the wild progenitor Solanum pimpinellifolium. The content of branched- (isoleucine and valine) and aromatic (phenylalanine and tryptophan) amino acids, citrate and sugars were significantly different in the fruit of several “criollo” tomatoes compared to S. pimpinellifolium. The transcriptomic profile of the ripe fruit showed several genes significantly and highly regulated in all varieties compared to S. pimpinellifolium, like genes encoding histones and mitochondrial proteins. Additionally, network analysis including transcripts and metabolites identified major hubs with the largest number of connections such as constitutive photomorphogenic protein 1 (a RING finger-type ubiquitin E3 ligase), five Zn finger transcription factors, ascorbate peroxidase, acetolactate synthase, and sucrose non-fermenting 1 kinase. Co-expression analysis of these genes revealed a potential function in acquiring tomato fruit quality during domestication.
EEA La Consulta
Fil: D'Angelo, Matilde. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universitat Autónoma de Barcelona. Animal and Food Science Department. Animal Nutrition and Welfare Service; España
Fil: Zanor, María Inés. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Burgos, Estanislao. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina.
Fil: Asprelli, Pablo. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; Argentina
Fil: Boggio, Silvana Beatriz. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Carrari, Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina.
Fil: Peralta, Iris Edith. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de Zonas Aridas; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Valle, Estela M. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fuente
Planta : 1–14 (First Online: 16 September 2019)
Materia
Tomate
Solanum Lycopersicum
Variedades
Aminoácidos
Genética
Mitocondria
Tomatoes
Varieties
Amino Acids
Genetics
Mitochondria
Tomate Andino
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Fil: Burgos, Estanislao. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina.
Fil: Asprelli, Pablo. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; Argentina
Fil: Boggio, Silvana Beatriz. Universidad Nacional de Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Carrari, Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina.
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