Detección de regiones genómicas con elevado desequilibrio de ligamiento en poblaciones de vacuno de carne españolas con análisis de BovineHD BeadChip

• Autores: Mouresan, E. F.; González Rodríguez, A.; Munilla Leguizamón, Sebastián; Moreno, C.; Altarriba, J.; Díaz, C.; Baro, J. A.; Piedrafita, J.; Molina, A.; Cañas Alvarez, J. J.; Varona, L.
• Año de publicación: 2017
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: artículo
• Fuente: Archivos de Zootecnia; Vol.66, no.253; 59-65; https://www.uco.es/ucopress/index.php/es
• Materia: LINKAGE DISEQUILIBRIUM; BEEF CATTLE; DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO; VACUNO DE CARNE
• Institución: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía

Fil: Mouresan, E. F. Universidad de Zaragoza. Facultad de Veterinaria. Unidad de Mejora Genética. Zaragoza, España.
Fil: González Rodríguez, A. Universidad de Zaragoza. Facultad de Veterinaria. Unidad de Mejora Genética. Zaragoza, España.
Fil: Munilla Leguizamón, Sebastián. Universidad de Zaragoza. Facultad de Veterinaria. Unidad de Mejora Genética. Zaragoza, España.
Fil: Moreno, C. Universidad de Zaragoza. Facultad de Veterinaria. Unidad de Mejora Genética. Zaragoza, España.
Fil: Altarriba, J. Universidad de Zaragoza. Facultad de Veterinaria. Unidad de Mejora Genética. Zaragoza, España.
Fil: Díaz, C. Instituto Nacional de Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA). Mejora Genética Animal. Madrid, España.
Fil: Baro, J. A. Universidad de Valladolid. Departamento de Ciencias Agroforestales. Producción Animal. Valladolid. España.
Fil: Piedrafita, J. Universitad Autónoma de Barcelona. Ciencia Animal y de los Alimentos. Barcelona, España.
Fil: Molina, A. Universidad de Córdoba. Departamento de Genética. Córdoba. Spain.
Fil: Cañas Alvarez, J. J. Universitad Autónoma de Barcelona. Ciencia Animal y de los Alimentos. Barcelona, España.
Fil: Varona, L. Universidad de Zaragoza. Facultad de Veterinaria. Unidad de Mejora Genética. Zaragoza, España.
El objetivo de este trabajo fue evaluar el patrón de desequilibrio de ligamiento a lo largo del genoma en siete poblaciones españolas autóctonas de vacuno de carne (Asturiana de los Valles, Avileña Negra - Ibérica, Bruna dels Pirineus, Morucha, Pirenaica, Retinta y Rubia Gallega). Para ello, se utilizó el BovineHD BeadChip con el que se genotiparon 171 tríos formados por individuo/padre/madre. Después del filtrado, se dispuso de 573.134 SNP. A partir de esta información se definió un parámetro que mide el desequilibrio medio del genoma por regiones de 1Mb en cada una de las poblaciones. Los resultados mostraron que el desequilibrio de ligamiento es muy heterogéneo a lo largo del genoma y que, además, esta heterogeneidad es consistente entre poblaciones. Las causas de esta heterogeneidad pueden ser, o bien estructurales y atribuibles a una menor tasa de mutación y/o recombinación, o bien consecuencia de procesos de selección estabilizadora.
Vtbls., grafs.