DNA Barcoding Southwestern Atlantic Skates: A 20-Year Effort in Building a Species Identification Library

Autores
Mabragaña, Ezequiel; Gabbanelli, Valeria; Matusevich, Florencia; Vazquez, Diego Martin; Delpiani, Sergio Matias; Lenain, Victoria Malvina; Rosso, Juan Jose; González Castro, Mariano; Hanner, Robert; Díaz de Astarloa, Juan Martín
Año de publicación
2025
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The skate fauna in the Southwest Atlantic Ocean (SWA; 34–55° S) is represented by ~32 species, many of which share external features that have led to misidentifications and deficient fishery statistics. The use of DNA barcoding to discriminate SWA skate species was explored after 20 years of surveys. COI sequences were subjected to distance-based neighbor-joining (NJ), maximum likelihood (ML), barcode index number (BIN), automatic barcode gap discovery (ABGD), and nucleotide diagnostic character (NDC) analyses. For widely distributed species, a haplotype network was built. Overall, 187 specimens and 31 egg cases from 26 skate species were barcoded. NJ and ML analyses showed that nearly all species exhibited unique barcodes or clusters of closely related haplotypes, except for Psammobatis normani/P. rudis and Dipturus trachyderma/D. argentinensis. The first pair was discriminated by NCD. BIN analysis recovered 17 groups, whereas ABGD recovered 23, better reflecting taxonomic diversity. In summary, 24 species were resolved by COI. Phylogeographic signals were observed for Amblyraja doellojuradoi and Zearaja brevicaudata. Compiling our results with data from BOLD, almost all the species occurring in the area possess barcodes, contributing to completing and curating the BOLD reference library, which constitutes an important tool for resolving taxonomic issues, tracing fishery products, and performing eDNA biomonitoring.
Fil: Mabragaña, Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: Gabbanelli, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: Matusevich, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: Vazquez, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: Delpiani, Sergio Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; Argentina
Fil: Lenain, Victoria Malvina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: Rosso, Juan Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: González Castro, Mariano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Fil: Hanner, Robert. University of Guelph; Canadá
Fil: Díaz de Astarloa, Juan Martín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Materia
Chondrichthyes
Skates
Diversity
DNA barcoding
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaFil: González Castro, Mariano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaFil: Hanner, Robert. University of Guelph; CanadáFil: Díaz de Astarloa, Juan Martín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. 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