High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification...

Autores
Bolatti, Elisa Maria; Hošnjak, Lea; Chouhy, Diego; Ré, María Florencia; Casal, Pablo Ezequiel; Bottai, Hebe María; Kocjan, Boštjan J.; Stella, Emma Julieta; Gorosito, Mario D.; Sanchez, Adriana; Bussy, Ramón Fernandez; Poljak, Mario; Giri, Adriana Angelica
Año de publicación
2018
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Genus Gammapapillomavirus (Gamma-PV) is the most diverse and largest clade within the Papillomaviridae family. A novel set of degenerate primers targeting the E1 gene was designed and further used in combination with the well-known CUT PCR assay to assess HPV prevalence and genus distribution in a variety of cutaneous samples from 448 immunocompetent individuals. General HPV, Gamma-PV and mixed infections prevalence were significantly higher in actinic keratosis with respect to benign and malignant neoplasms, respectively (p = 0.0047, p = 0.0172, p = 0.00001). Gamma-PVs were significantly more common in actinic keratosis biopsies than Beta- and Alpha-PVs (p = 0.002). The full-length genome sequence of a novel putative Gamma-PV type was amplified by ‘hanging droplet’ long-range PCR and cloned. The novel virus, designated HPV210, clustered within species Gamma-12. This study provides an additional tool enabling detection of HPV infections in skin and adds new insights about possible early roles of Gamma-PVs in the development of cutaneous malignant lesions.
Fil: Bolatti, Elisa Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Hošnjak, Lea. University of Ljubljana; Eslovenia
Fil: Chouhy, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Ré, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Casal, Pablo Ezequiel. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
Fil: Bottai, Hebe María. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
Fil: Kocjan, Boštjan J.. University of Ljubljana; Eslovenia
Fil: Stella, Emma Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Gorosito, Mario D.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
Fil: Sanchez, Adriana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
Fil: Bussy, Ramón Fernandez. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
Fil: Poljak, Mario. University of Ljubljana; Eslovenia
Fil: Giri, Adriana Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Materia
ACTINIC KERATOSIS
CUT PCR ASSAY
GAMMA-PV PCR
GAMMAPAPILLOMAVIRUS
GENOMIC CHARACTERIZATION
HPV210
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/88573

id CONICETDig_d87aaf89df95c4491a57794c2b23cda5
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/88573
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV typeBolatti, Elisa MariaHošnjak, LeaChouhy, DiegoRé, María FlorenciaCasal, Pablo EzequielBottai, Hebe MaríaKocjan, Boštjan J.Stella, Emma JulietaGorosito, Mario D.Sanchez, AdrianaBussy, Ramón FernandezPoljak, MarioGiri, Adriana AngelicaACTINIC KERATOSISCUT PCR ASSAYGAMMA-PV PCRGAMMAPAPILLOMAVIRUSGENOMIC CHARACTERIZATIONHPV210https://purl.org/becyt/ford/3.1https://purl.org/becyt/ford/3Genus Gammapapillomavirus (Gamma-PV) is the most diverse and largest clade within the Papillomaviridae family. A novel set of degenerate primers targeting the E1 gene was designed and further used in combination with the well-known CUT PCR assay to assess HPV prevalence and genus distribution in a variety of cutaneous samples from 448 immunocompetent individuals. General HPV, Gamma-PV and mixed infections prevalence were significantly higher in actinic keratosis with respect to benign and malignant neoplasms, respectively (p = 0.0047, p = 0.0172, p = 0.00001). Gamma-PVs were significantly more common in actinic keratosis biopsies than Beta- and Alpha-PVs (p = 0.002). The full-length genome sequence of a novel putative Gamma-PV type was amplified by ‘hanging droplet’ long-range PCR and cloned. The novel virus, designated HPV210, clustered within species Gamma-12. This study provides an additional tool enabling detection of HPV infections in skin and adds new insights about possible early roles of Gamma-PVs in the development of cutaneous malignant lesions.Fil: Bolatti, Elisa Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Hošnjak, Lea. University of Ljubljana; EsloveniaFil: Chouhy, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Ré, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Casal, Pablo Ezequiel. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Bottai, Hebe María. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Kocjan, Boštjan J.. University of Ljubljana; EsloveniaFil: Stella, Emma Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Gorosito, Mario D.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Sanchez, Adriana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Bussy, Ramón Fernandez. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; ArgentinaFil: Poljak, Mario. University of Ljubljana; EsloveniaFil: Giri, Adriana Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaAcademic Press Inc Elsevier Science2018-12info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/88573Bolatti, Elisa Maria; Hošnjak, Lea; Chouhy, Diego; Ré, María Florencia; Casal, Pablo Ezequiel; et al.; High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type; Academic Press Inc Elsevier Science; Virology; 525; 12-2018; 182-1910042-6822CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.virol.2018.09.006info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682218302770info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-15T14:26:54Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/88573instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-15 14:26:54.669CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
title High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
spellingShingle High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
Bolatti, Elisa Maria
ACTINIC KERATOSIS
CUT PCR ASSAY
GAMMA-PV PCR
GAMMAPAPILLOMAVIRUS
GENOMIC CHARACTERIZATION
HPV210
title_short High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
title_full High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
title_fullStr High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
title_full_unstemmed High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
title_sort High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type
dc.creator.none.fl_str_mv Bolatti, Elisa Maria
Hošnjak, Lea
Chouhy, Diego
Ré, María Florencia
Casal, Pablo Ezequiel
Bottai, Hebe María
Kocjan, Boštjan J.
Stella, Emma Julieta
Gorosito, Mario D.
Sanchez, Adriana
Bussy, Ramón Fernandez
Poljak, Mario
Giri, Adriana Angelica
author Bolatti, Elisa Maria
author_facet Bolatti, Elisa Maria
Hošnjak, Lea
Chouhy, Diego
Ré, María Florencia
Casal, Pablo Ezequiel
Bottai, Hebe María
Kocjan, Boštjan J.
Stella, Emma Julieta
Gorosito, Mario D.
Sanchez, Adriana
Bussy, Ramón Fernandez
Poljak, Mario
Giri, Adriana Angelica
author_role author
author2 Hošnjak, Lea
Chouhy, Diego
Ré, María Florencia
Casal, Pablo Ezequiel
Bottai, Hebe María
Kocjan, Boštjan J.
Stella, Emma Julieta
Gorosito, Mario D.
Sanchez, Adriana
Bussy, Ramón Fernandez
Poljak, Mario
Giri, Adriana Angelica
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv ACTINIC KERATOSIS
CUT PCR ASSAY
GAMMA-PV PCR
GAMMAPAPILLOMAVIRUS
GENOMIC CHARACTERIZATION
HPV210
topic ACTINIC KERATOSIS
CUT PCR ASSAY
GAMMA-PV PCR
GAMMAPAPILLOMAVIRUS
GENOMIC CHARACTERIZATION
HPV210
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/3.1
https://purl.org/becyt/ford/3
dc.description.none.fl_txt_mv Genus Gammapapillomavirus (Gamma-PV) is the most diverse and largest clade within the Papillomaviridae family. A novel set of degenerate primers targeting the E1 gene was designed and further used in combination with the well-known CUT PCR assay to assess HPV prevalence and genus distribution in a variety of cutaneous samples from 448 immunocompetent individuals. General HPV, Gamma-PV and mixed infections prevalence were significantly higher in actinic keratosis with respect to benign and malignant neoplasms, respectively (p = 0.0047, p = 0.0172, p = 0.00001). Gamma-PVs were significantly more common in actinic keratosis biopsies than Beta- and Alpha-PVs (p = 0.002). The full-length genome sequence of a novel putative Gamma-PV type was amplified by ‘hanging droplet’ long-range PCR and cloned. The novel virus, designated HPV210, clustered within species Gamma-12. This study provides an additional tool enabling detection of HPV infections in skin and adds new insights about possible early roles of Gamma-PVs in the development of cutaneous malignant lesions.
Fil: Bolatti, Elisa Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Hošnjak, Lea. University of Ljubljana; Eslovenia
Fil: Chouhy, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Ré, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Casal, Pablo Ezequiel. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
Fil: Bottai, Hebe María. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
Fil: Kocjan, Boštjan J.. University of Ljubljana; Eslovenia
Fil: Stella, Emma Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Gorosito, Mario D.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
Fil: Sanchez, Adriana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
Fil: Bussy, Ramón Fernandez. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
Fil: Poljak, Mario. University of Ljubljana; Eslovenia
Fil: Giri, Adriana Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
description Genus Gammapapillomavirus (Gamma-PV) is the most diverse and largest clade within the Papillomaviridae family. A novel set of degenerate primers targeting the E1 gene was designed and further used in combination with the well-known CUT PCR assay to assess HPV prevalence and genus distribution in a variety of cutaneous samples from 448 immunocompetent individuals. General HPV, Gamma-PV and mixed infections prevalence were significantly higher in actinic keratosis with respect to benign and malignant neoplasms, respectively (p = 0.0047, p = 0.0172, p = 0.00001). Gamma-PVs were significantly more common in actinic keratosis biopsies than Beta- and Alpha-PVs (p = 0.002). The full-length genome sequence of a novel putative Gamma-PV type was amplified by ‘hanging droplet’ long-range PCR and cloned. The novel virus, designated HPV210, clustered within species Gamma-12. This study provides an additional tool enabling detection of HPV infections in skin and adds new insights about possible early roles of Gamma-PVs in the development of cutaneous malignant lesions.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-12
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/88573
Bolatti, Elisa Maria; Hošnjak, Lea; Chouhy, Diego; Ré, María Florencia; Casal, Pablo Ezequiel; et al.; High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type; Academic Press Inc Elsevier Science; Virology; 525; 12-2018; 182-191
0042-6822
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/88573
identifier_str_mv Bolatti, Elisa Maria; Hošnjak, Lea; Chouhy, Diego; Ré, María Florencia; Casal, Pablo Ezequiel; et al.; High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type; Academic Press Inc Elsevier Science; Virology; 525; 12-2018; 182-191
0042-6822
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.virol.2018.09.006
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682218302770
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Academic Press Inc Elsevier Science
publisher.none.fl_str_mv Academic Press Inc Elsevier Science
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846082719697600512
score 13.22299