Reassessment of genotype 1 hepatitis c virus subtype misclassification by LiPA 2.0: implications for direct-acting antiviral treatment

Authors
Guelfo, Javier R.; Macias, Juan; Neukam, Karin; Di Lello, Federico Alejandro; Mira José Antonio; Merchante, Nicolás; Mancebo, María; Nuñez Torres, Rocío; Pineda, Juan A.; Real. Luis M.
Publication Year
2014
Language
English
Format
article
Status
Published version
Description
The accuracy of LiPA 2.0 for hepatitis C virus 1 (HCV-1) subtype classification was analyzed. LiPA 2.0 genotype results from 101 HCV-1-infected patients were compared to genotype findings determined by direct core sequencing. Eleven (11%) samples were misclassified. Given the influence of the HCV-1-subtype in the anti-HCV therapy response, an alternative classification method is warranted.
Fil: Guelfo, Javier R.. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Macias, Juan. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Neukam, Karin. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Di Lello, Federico Alejandro. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Mira José Antonio. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Merchante, Nicolás. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Mancebo, María. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Nuñez Torres, Rocío. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Pineda, Juan A.. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Fil: Real. Luis M.. Hospital Universitario de Valme. Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología; España
Subject
Heptitis C Virus
Genotype
Lipa
Core
Gastroenterología y Hepatología
Medicina Clínica
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
Access level
Open access
License
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repository
CONICET Digital (CONICET)
Institution
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identifier
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/15782