QSAR on antiproliferative naphthoquinones based on a conformation-independent approach

Autores
Duchowicz, Pablo Román; Bennardi, Daniel Oscar; Bacelo, Daniel Enrique; Bonifazi, Evelyn Lucia; Ríos Luci, Carla; Padron, José M.; Burton, Gerardo; Misico, Rosana Isabel
Año de publicación
2014
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The antiproliferative activities of a series of 36 naphthoquinone derivatives were subjected to a Quantitative Structure–Activity Relationships (QSAR) study. For this purpose a panel of four human cancer cell lines was used, namely HBL-100 (breast), HeLa (cervix), SW-1573 (non-small cell lung) and WiDr (colon). A conformation-independent representation of the chemical structure was established in order to avoid leading with the scarce experimental information on X-ray crystal structure of the drug interaction. The 1179 theoretical descriptors derived with E-Dragon and Recon software were simultaneously analyzed through linear regression models based on the Replacement Method variable subset selection technique. The established models were validated and tested through the use of external test sets of compounds, the Leave-One-Out Cross Validation method, Y-Randomization and Applicability Domain analysis.
Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
Fil: Bennardi, Daniel Oscar. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Bacelo, Daniel Enrique. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Bonifazi, Evelyn Lucia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina
Fil: Ríos Luci, Carla. Universidad de la Laguna. Departamento de Química Orgánica. Instituto Universitario de Bio-Orgánica "Antonio González"; España
Fil: Padron, José M.. Universidad de la Laguna. Departamento de Química Orgánica. Instituto Universitario de Bio-Orgánica "Antonio González"; España
Fil: Burton, Gerardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina
Fil: Misico, Rosana Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina
Materia
Qsar
Molecular Descriptors
Multivariable Linear Regression
Cancer
Naphthoquinone Derivatives
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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