QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors

Autores
Duchowicz, Pablo Román; Bacelo, Daniel Enrique; Fioressi, Silvina Ethel; Palermo, Valeria; Ibezim, Nnenna E.; Romanelli, Gustavo Pablo
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The inhibitory HIV reverse transcriptase activity of 172 non-nucleoside indoyl aryl sulfones and sulfides is studied with a QSAR analysis, in order to identify the molecular characteristics influencing the interaction with the reverse transcriptase enzyme. This work increases the available QSAR studies of indoyl aryl sulfones and sulfides using the reported experimental EC50 values against HIV-1 wild type (IIIB) in human T-lymphocyte (CEM) cells. Different approaches are proposed, involving 0D, 1D and 2D molecular descriptors from PaDEL freeware, and also based on flexible descriptors from CORAL freeware. Three models are finally presented, which correlate the inhibitory HIV reverse transcriptase activity with good accuracy. It is demonstrated that the established models are predictive in the validation process. The novelty of the present work relies on the development of structure-inhibitory HIV activity relationships, through a computational technique that does not require the knowledge of the molecular conformation during the structural representation. The obtained results would contribute to guide the design of more effective compounds for HIV treatment.
Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
Fil: Bacelo, Daniel Enrique. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Fioressi, Silvina Ethel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química; Argentina
Fil: Palermo, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas "Dr. Jorge J. Ronco". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas; Argentina
Fil: Ibezim, Nnenna E.. University of Nigeria; Nigeria
Fil: Romanelli, Gustavo Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas "Dr. Jorge J. Ronco". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Exactas. Cátedra de Química Orgánica; Argentina
Materia
Coral
Hiv Reverse Transcriptase Inhibitors
Indoyl Aryl Sulfides And Sulfones
Padel
Qsar
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/41177

id CONICETDig_94d5745d18fbfa7eca02f20a09eab097
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/41177
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitorsDuchowicz, Pablo RománBacelo, Daniel EnriqueFioressi, Silvina EthelPalermo, ValeriaIbezim, Nnenna E.Romanelli, Gustavo PabloCoralHiv Reverse Transcriptase InhibitorsIndoyl Aryl Sulfides And SulfonesPadelQsarhttps://purl.org/becyt/ford/1.4https://purl.org/becyt/ford/1The inhibitory HIV reverse transcriptase activity of 172 non-nucleoside indoyl aryl sulfones and sulfides is studied with a QSAR analysis, in order to identify the molecular characteristics influencing the interaction with the reverse transcriptase enzyme. This work increases the available QSAR studies of indoyl aryl sulfones and sulfides using the reported experimental EC50 values against HIV-1 wild type (IIIB) in human T-lymphocyte (CEM) cells. Different approaches are proposed, involving 0D, 1D and 2D molecular descriptors from PaDEL freeware, and also based on flexible descriptors from CORAL freeware. Three models are finally presented, which correlate the inhibitory HIV reverse transcriptase activity with good accuracy. It is demonstrated that the established models are predictive in the validation process. The novelty of the present work relies on the development of structure-inhibitory HIV activity relationships, through a computational technique that does not require the knowledge of the molecular conformation during the structural representation. The obtained results would contribute to guide the design of more effective compounds for HIV treatment.Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Bacelo, Daniel Enrique. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fioressi, Silvina Ethel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química; ArgentinaFil: Palermo, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas "Dr. Jorge J. Ronco". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas; ArgentinaFil: Ibezim, Nnenna E.. University of Nigeria; NigeriaFil: Romanelli, Gustavo Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas "Dr. Jorge J. Ronco". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Exactas. Cátedra de Química Orgánica; ArgentinaBirkhauser Boston Inc2017-09info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/41177Duchowicz, Pablo Román; Bacelo, Daniel Enrique; Fioressi, Silvina Ethel; Palermo, Valeria; Ibezim, Nnenna E.; et al.; QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors; Birkhauser Boston Inc; Medicinal Chemistry Research; 27; 2; 9-2017; 420-4281054-2523CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00044-017-2069-5info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00044-017-2069-5info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T09:50:41Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/41177instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 09:50:41.427CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
title QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
spellingShingle QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
Duchowicz, Pablo Román
Coral
Hiv Reverse Transcriptase Inhibitors
Indoyl Aryl Sulfides And Sulfones
Padel
Qsar
title_short QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
title_full QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
title_fullStr QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
title_full_unstemmed QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
title_sort QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors
dc.creator.none.fl_str_mv Duchowicz, Pablo Román
Bacelo, Daniel Enrique
Fioressi, Silvina Ethel
Palermo, Valeria
Ibezim, Nnenna E.
Romanelli, Gustavo Pablo
author Duchowicz, Pablo Román
author_facet Duchowicz, Pablo Román
Bacelo, Daniel Enrique
Fioressi, Silvina Ethel
Palermo, Valeria
Ibezim, Nnenna E.
Romanelli, Gustavo Pablo
author_role author
author2 Bacelo, Daniel Enrique
Fioressi, Silvina Ethel
Palermo, Valeria
Ibezim, Nnenna E.
Romanelli, Gustavo Pablo
author2_role author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Coral
Hiv Reverse Transcriptase Inhibitors
Indoyl Aryl Sulfides And Sulfones
Padel
Qsar
topic Coral
Hiv Reverse Transcriptase Inhibitors
Indoyl Aryl Sulfides And Sulfones
Padel
Qsar
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.4
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv The inhibitory HIV reverse transcriptase activity of 172 non-nucleoside indoyl aryl sulfones and sulfides is studied with a QSAR analysis, in order to identify the molecular characteristics influencing the interaction with the reverse transcriptase enzyme. This work increases the available QSAR studies of indoyl aryl sulfones and sulfides using the reported experimental EC50 values against HIV-1 wild type (IIIB) in human T-lymphocyte (CEM) cells. Different approaches are proposed, involving 0D, 1D and 2D molecular descriptors from PaDEL freeware, and also based on flexible descriptors from CORAL freeware. Three models are finally presented, which correlate the inhibitory HIV reverse transcriptase activity with good accuracy. It is demonstrated that the established models are predictive in the validation process. The novelty of the present work relies on the development of structure-inhibitory HIV activity relationships, through a computational technique that does not require the knowledge of the molecular conformation during the structural representation. The obtained results would contribute to guide the design of more effective compounds for HIV treatment.
Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
Fil: Bacelo, Daniel Enrique. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Fioressi, Silvina Ethel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química; Argentina
Fil: Palermo, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas "Dr. Jorge J. Ronco". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas; Argentina
Fil: Ibezim, Nnenna E.. University of Nigeria; Nigeria
Fil: Romanelli, Gustavo Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas "Dr. Jorge J. Ronco". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Ciencias Aplicadas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Exactas. Cátedra de Química Orgánica; Argentina
description The inhibitory HIV reverse transcriptase activity of 172 non-nucleoside indoyl aryl sulfones and sulfides is studied with a QSAR analysis, in order to identify the molecular characteristics influencing the interaction with the reverse transcriptase enzyme. This work increases the available QSAR studies of indoyl aryl sulfones and sulfides using the reported experimental EC50 values against HIV-1 wild type (IIIB) in human T-lymphocyte (CEM) cells. Different approaches are proposed, involving 0D, 1D and 2D molecular descriptors from PaDEL freeware, and also based on flexible descriptors from CORAL freeware. Three models are finally presented, which correlate the inhibitory HIV reverse transcriptase activity with good accuracy. It is demonstrated that the established models are predictive in the validation process. The novelty of the present work relies on the development of structure-inhibitory HIV activity relationships, through a computational technique that does not require the knowledge of the molecular conformation during the structural representation. The obtained results would contribute to guide the design of more effective compounds for HIV treatment.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-09
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/41177
Duchowicz, Pablo Román; Bacelo, Daniel Enrique; Fioressi, Silvina Ethel; Palermo, Valeria; Ibezim, Nnenna E.; et al.; QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors; Birkhauser Boston Inc; Medicinal Chemistry Research; 27; 2; 9-2017; 420-428
1054-2523
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/41177
identifier_str_mv Duchowicz, Pablo Román; Bacelo, Daniel Enrique; Fioressi, Silvina Ethel; Palermo, Valeria; Ibezim, Nnenna E.; et al.; QSAR studies of indoyl aryl sulfides and sulfones as reverse transcriptase inhibitors; Birkhauser Boston Inc; Medicinal Chemistry Research; 27; 2; 9-2017; 420-428
1054-2523
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00044-017-2069-5
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00044-017-2069-5
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Birkhauser Boston Inc
publisher.none.fl_str_mv Birkhauser Boston Inc
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1842269047331225600
score 13.13397