Metagenome-derived draft genome sequence of acidithiobacillus ferrooxidans RV1 from an abandoned gold tailing in neuquén, Argentina

Autores
Ulloa, José Ricardo; Moya Beltrán, Ana; Issotta, Francisco; Nuñez, Harold; Covarrubias, Paulo C.; Donati, Edgardo Ruben; Quatrini, Raquel; Giaveno Filippa, Maria Alejandra
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
In this work we report the metagenome-derived draft genomic sequence of an enrichment culture dominated by A. ferrooxidans obtained from an airlift bioreactor inoculated with the microbial consortium recovered from the “Relave Viejo” tailing. The genome of this culture was assembled de-novo and by reference, generating a consensus assembly of 3.0 Mb. On the basis of 16S rRNA (100 % identity), average nucleotide identity analysis (99.33% identity) and in silico DNA-DNA hybridization against A. ferrooxidans ATCC 23270T (97.9%), the recovered genome is confirmed to pertain to A. ferrooxidans species. Comparative genomics results are presented to uncover the genetic traits of the variant surviving lime treatment and to further explore the genomic diversity of these model iron oxidizing species.
Fil: Ulloa, José Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas. Universidad Nacional del Comahue. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; Argentina
Fil: Moya Beltrán, Ana. Fundación Ciencia & Vida; Chile
Fil: Issotta, Francisco. Fundación Ciencia & Vida; Chile
Fil: Nuñez, Harold. Fundación Ciencia & Vida; Chile
Fil: Covarrubias, Paulo C.. Fundación Ciencia & Vida; Chile
Fil: Donati, Edgardo Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
Fil: Quatrini, Raquel. Fundación Ciencia & Vida; Chile
Fil: Giaveno Filippa, Maria Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas. Universidad Nacional del Comahue. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; Argentina
Materia
ABANDONED TAILING
ACIDITHIOBACILLUS FERROOXIDANS RV1
GOLD MINE
LIME TREATMENT
NORTHERN PATAGAONIA
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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