Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain

Autores
Fernandez, Maricruz; Godino, Agustina; Principe, Analia; López Ramírez, Viviana; Quesada, José Miguel; Rigo, Virginia; Espinosa-Urgel, Manuel; Morales, Gustavo Marcelo; Fischer, Sonia Elizabeth
Año de publicación
2020
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The emergence of antibiotic resistant bacterial strains demands the development of new antimicrobial agents. In the last decades, bacteriocins have gained significant interest due to their potential application as biopreservatives in the food industry and as therapeutic agents in medicine. Recent studies project the use of these antimicrobials in agriculture as biocontrol agents. The characterization of bacteriocins and their genetic regulation, however, have been scarcely studied in plant-associated bacteria. In this report, an in-silico and proteomic analysis was performed to identify the bacteriocins produced by Pseudomonas fluorescens SF4c. More than one functional bacteriocin was detected in this strain (S-type bacteriocins and phage-tail-like bacteriocins [tailocins]). It is known that the regulator PrtR represses bacteriocin production in P. aeruginosa under normal condition. However, the mechanism for tailocin regulation remains unknown in plant-associated pseudomonads. In this work, an orthologue of the prtR of P. aeruginosa was identified in the SF4c-tailocin cluster and a prtR null mutant constructed. The expression and production of tailocins was abolished in this mutant; thus evidencing that, unlike P. aeruginosa, PrtR is a positive regulator of tailocins expression in P. fluorescens.
Fil: Fernandez, Maricruz. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Godino, Agustina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Principe, Analia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: López Ramírez, Viviana. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Quesada, José Miguel. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Estación Experimental del Zaidín; España
Fil: Rigo, Virginia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Espinosa-Urgel, Manuel. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Estación Experimental del Zaidín; España
Fil: Morales, Gustavo Marcelo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones en Tecnologías Energéticas y Materiales Avanzados. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Tecnologías Energéticas y Materiales Avanzados; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Química; Argentina
Fil: Fischer, Sonia Elizabeth. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Materia
BACTERIOCIN
PROMOTER
PSEUDOMONAS FLUORESCENS
PYOCIN
REGULATION
TAILOCIN
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/123689

id CONICETDig_8d8e040c25e092865a3312ae8b3ca1e4
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/123689
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strainFernandez, MaricruzGodino, AgustinaPrincipe, AnaliaLópez Ramírez, VivianaQuesada, José MiguelRigo, VirginiaEspinosa-Urgel, ManuelMorales, Gustavo MarceloFischer, Sonia ElizabethBACTERIOCINPROMOTERPSEUDOMONAS FLUORESCENSPYOCINREGULATIONTAILOCINhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1The emergence of antibiotic resistant bacterial strains demands the development of new antimicrobial agents. In the last decades, bacteriocins have gained significant interest due to their potential application as biopreservatives in the food industry and as therapeutic agents in medicine. Recent studies project the use of these antimicrobials in agriculture as biocontrol agents. The characterization of bacteriocins and their genetic regulation, however, have been scarcely studied in plant-associated bacteria. In this report, an in-silico and proteomic analysis was performed to identify the bacteriocins produced by Pseudomonas fluorescens SF4c. More than one functional bacteriocin was detected in this strain (S-type bacteriocins and phage-tail-like bacteriocins [tailocins]). It is known that the regulator PrtR represses bacteriocin production in P. aeruginosa under normal condition. However, the mechanism for tailocin regulation remains unknown in plant-associated pseudomonads. In this work, an orthologue of the prtR of P. aeruginosa was identified in the SF4c-tailocin cluster and a prtR null mutant constructed. The expression and production of tailocins was abolished in this mutant; thus evidencing that, unlike P. aeruginosa, PrtR is a positive regulator of tailocins expression in P. fluorescens.Fil: Fernandez, Maricruz. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; ArgentinaFil: Godino, Agustina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; ArgentinaFil: Principe, Analia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; ArgentinaFil: López Ramírez, Viviana. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; ArgentinaFil: Quesada, José Miguel. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Estación Experimental del Zaidín; EspañaFil: Rigo, Virginia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; ArgentinaFil: Espinosa-Urgel, Manuel. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Estación Experimental del Zaidín; EspañaFil: Morales, Gustavo Marcelo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones en Tecnologías Energéticas y Materiales Avanzados. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Tecnologías Energéticas y Materiales Avanzados; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Química; ArgentinaFil: Fischer, Sonia Elizabeth. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; ArgentinaElsevier Science2020-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/123689Fernandez, Maricruz; Godino, Agustina; Principe, Analia; López Ramírez, Viviana; Quesada, José Miguel; et al.; Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain; Elsevier Science; Journal of Biotechnology; 307; 1-2020; 182-1920168-1656CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.jbiotec.2019.11.003info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0168165619309137info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T10:02:28Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/123689instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 10:02:28.576CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
title Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
spellingShingle Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
Fernandez, Maricruz
BACTERIOCIN
PROMOTER
PSEUDOMONAS FLUORESCENS
PYOCIN
REGULATION
TAILOCIN
title_short Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
title_full Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
title_fullStr Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
title_full_unstemmed Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
title_sort Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain
dc.creator.none.fl_str_mv Fernandez, Maricruz
Godino, Agustina
Principe, Analia
López Ramírez, Viviana
Quesada, José Miguel
Rigo, Virginia
Espinosa-Urgel, Manuel
Morales, Gustavo Marcelo
Fischer, Sonia Elizabeth
author Fernandez, Maricruz
author_facet Fernandez, Maricruz
Godino, Agustina
Principe, Analia
López Ramírez, Viviana
Quesada, José Miguel
Rigo, Virginia
Espinosa-Urgel, Manuel
Morales, Gustavo Marcelo
Fischer, Sonia Elizabeth
author_role author
author2 Godino, Agustina
Principe, Analia
López Ramírez, Viviana
Quesada, José Miguel
Rigo, Virginia
Espinosa-Urgel, Manuel
Morales, Gustavo Marcelo
Fischer, Sonia Elizabeth
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv BACTERIOCIN
PROMOTER
PSEUDOMONAS FLUORESCENS
PYOCIN
REGULATION
TAILOCIN
topic BACTERIOCIN
PROMOTER
PSEUDOMONAS FLUORESCENS
PYOCIN
REGULATION
TAILOCIN
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv The emergence of antibiotic resistant bacterial strains demands the development of new antimicrobial agents. In the last decades, bacteriocins have gained significant interest due to their potential application as biopreservatives in the food industry and as therapeutic agents in medicine. Recent studies project the use of these antimicrobials in agriculture as biocontrol agents. The characterization of bacteriocins and their genetic regulation, however, have been scarcely studied in plant-associated bacteria. In this report, an in-silico and proteomic analysis was performed to identify the bacteriocins produced by Pseudomonas fluorescens SF4c. More than one functional bacteriocin was detected in this strain (S-type bacteriocins and phage-tail-like bacteriocins [tailocins]). It is known that the regulator PrtR represses bacteriocin production in P. aeruginosa under normal condition. However, the mechanism for tailocin regulation remains unknown in plant-associated pseudomonads. In this work, an orthologue of the prtR of P. aeruginosa was identified in the SF4c-tailocin cluster and a prtR null mutant constructed. The expression and production of tailocins was abolished in this mutant; thus evidencing that, unlike P. aeruginosa, PrtR is a positive regulator of tailocins expression in P. fluorescens.
Fil: Fernandez, Maricruz. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Godino, Agustina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Principe, Analia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: López Ramírez, Viviana. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Quesada, José Miguel. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Estación Experimental del Zaidín; España
Fil: Rigo, Virginia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
Fil: Espinosa-Urgel, Manuel. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Estación Experimental del Zaidín; España
Fil: Morales, Gustavo Marcelo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones en Tecnologías Energéticas y Materiales Avanzados. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Tecnologías Energéticas y Materiales Avanzados; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Química; Argentina
Fil: Fischer, Sonia Elizabeth. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina
description The emergence of antibiotic resistant bacterial strains demands the development of new antimicrobial agents. In the last decades, bacteriocins have gained significant interest due to their potential application as biopreservatives in the food industry and as therapeutic agents in medicine. Recent studies project the use of these antimicrobials in agriculture as biocontrol agents. The characterization of bacteriocins and their genetic regulation, however, have been scarcely studied in plant-associated bacteria. In this report, an in-silico and proteomic analysis was performed to identify the bacteriocins produced by Pseudomonas fluorescens SF4c. More than one functional bacteriocin was detected in this strain (S-type bacteriocins and phage-tail-like bacteriocins [tailocins]). It is known that the regulator PrtR represses bacteriocin production in P. aeruginosa under normal condition. However, the mechanism for tailocin regulation remains unknown in plant-associated pseudomonads. In this work, an orthologue of the prtR of P. aeruginosa was identified in the SF4c-tailocin cluster and a prtR null mutant constructed. The expression and production of tailocins was abolished in this mutant; thus evidencing that, unlike P. aeruginosa, PrtR is a positive regulator of tailocins expression in P. fluorescens.
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020-01
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/123689
Fernandez, Maricruz; Godino, Agustina; Principe, Analia; López Ramírez, Viviana; Quesada, José Miguel; et al.; Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain; Elsevier Science; Journal of Biotechnology; 307; 1-2020; 182-192
0168-1656
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/123689
identifier_str_mv Fernandez, Maricruz; Godino, Agustina; Principe, Analia; López Ramírez, Viviana; Quesada, José Miguel; et al.; Characterization of the bacteriocins and the PrtR regulator in a plant-associated Pseudomonas strain; Elsevier Science; Journal of Biotechnology; 307; 1-2020; 182-192
0168-1656
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.jbiotec.2019.11.003
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0168165619309137
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Elsevier Science
publisher.none.fl_str_mv Elsevier Science
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1842269757724688384
score 12.885934