Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie k...
- Autores
- Niella, Fernando Omar; Rocha, Sandra Patricia; Ojeda, Paola; Petruszynski, Guido Andrés; Zapata, Pedro Dario; Otegui, Monica Beatriz
- Año de publicación
- 2017
- Idioma
- español castellano
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- La fragmentación del hábitat es una realidad global, y muy presente en la Selva paranaense. Entre las especies vulnerables y/o amenazadas por la fragmentación del hábitat, en la Selva paranaense, podemos mencionar a Peltophorum dubium (Caña fístula) y Enterolobium contortisiliquum (Timbó), que particularmente en Misiones, se encuentran entre las de mayor interés para la industria forestal, consideradas también, como especies multipropósitos. No obstante, un uso sostenible de estas especies depende del manejo de la diversidad de especies de árboles presentes en paisajes y la variación genética dentro de estas. En Argentina no existe información acerca de la calidad genética que se conjugue con las características fenotípicas de dichas especies. En este sentido, los microsatélites son herramientas muy útiles para estudiar la diversidad genética y la estructura de las poblaciones. El objetivo del presente trabajo fue lograr la amplificación inter-específica de regiones de microsatélites de E. contortisiliquum, utilizando cebadores diseñados para E. cyclocarpum, y de P. dubium, utilizando cebadores diseñados para Koompassia malaccensis. Los resultados obtenidos confirmaron la transferibilidad de los cebadores utilizados para E. contortisiliquum y P. dubium, permitiendo amplificar regiones microsatélites de las especies estudiadas en poblaciones Argentinas. Este el primer estudio en Argentina que presenta microsatélites candidatos para E. contortisiliquum y P. dubium, que podrían ayudar en la caracterización del germoplasma.
The habit fragmentation is a global reality, and very present in the Atlantic Forest. Among the species vulnerable and / or threatened by habitat fragmentation, in the Atlantic Forest, we can mention Peltophorum dubium (Cañafistula) and Enterolobium contortisiliquum (Timbó), which particularly in Misiones, are among the most interest for the forest industry, considered as well as, multipurpose species. However, a sustainable use of these species depends on the management of the diversity of tree species present in landscapes and the genetic variation within them. In Argentina, there is no information about the genetic quality correlated with the phenotypic characteristics of these species. In this sense, microsatellites are very useful tools to study genetic diversity and the structure of populations. The aim of the present work was to achieve the inter- specific amplification of microsatellite regions in E. contortisiliquum, using primers designed for E. cyclocarpum, and in P. dubium, using primers designed for Koompassia malaccensis. The obtained results confirmed the transferability of the primers used for E. contortisiliquum and P. dubium, amplifying microsatellites of the species under study for Argentina ecosystem.This being the first report in Argentina, which presents microsatellite candidates for E. contortisiliquum and P. dubium, which could help in germplasm characterization.
Fil: Niella, Fernando Omar. Universidad Nacional de Misiones; Argentina
Fil: Rocha, Sandra Patricia. Universidad Nacional de Misiones; Argentina
Fil: Ojeda, Paola. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina
Fil: Petruszynski, Guido Andrés. Universidad Nacional de Misiones; Argentina
Fil: Zapata, Pedro Dario. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina
Fil: Otegui, Monica Beatriz. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina - Materia
-
TIMBO
CAÑAFISTULA
MARCADORES GENETICOS
DIVERSIDAD - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
- Repositorio
- Institución
- Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- OAI Identificador
- oai:ri.conicet.gov.ar:11336/82394
Ver los metadatos del registro completo
id |
CONICETDig_83d8a50e1c363ea5b090da94a42d51a2 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/82394 |
network_acronym_str |
CONICETDig |
repository_id_str |
3498 |
network_name_str |
CONICET Digital (CONICET) |
spelling |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb.Amplification of microsatelite markers in peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) andenterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), using koompassia malaccensis benth. andenterolobium cyclocarpum (jacq.) griseb as primersNiella, Fernando OmarRocha, Sandra PatriciaOjeda, PaolaPetruszynski, Guido AndrésZapata, Pedro DarioOtegui, Monica BeatrizTIMBOCAÑAFISTULAMARCADORES GENETICOSDIVERSIDADhttps://purl.org/becyt/ford/1.7https://purl.org/becyt/ford/1La fragmentación del hábitat es una realidad global, y muy presente en la Selva paranaense. Entre las especies vulnerables y/o amenazadas por la fragmentación del hábitat, en la Selva paranaense, podemos mencionar a Peltophorum dubium (Caña fístula) y Enterolobium contortisiliquum (Timbó), que particularmente en Misiones, se encuentran entre las de mayor interés para la industria forestal, consideradas también, como especies multipropósitos. No obstante, un uso sostenible de estas especies depende del manejo de la diversidad de especies de árboles presentes en paisajes y la variación genética dentro de estas. En Argentina no existe información acerca de la calidad genética que se conjugue con las características fenotípicas de dichas especies. En este sentido, los microsatélites son herramientas muy útiles para estudiar la diversidad genética y la estructura de las poblaciones. El objetivo del presente trabajo fue lograr la amplificación inter-específica de regiones de microsatélites de E. contortisiliquum, utilizando cebadores diseñados para E. cyclocarpum, y de P. dubium, utilizando cebadores diseñados para Koompassia malaccensis. Los resultados obtenidos confirmaron la transferibilidad de los cebadores utilizados para E. contortisiliquum y P. dubium, permitiendo amplificar regiones microsatélites de las especies estudiadas en poblaciones Argentinas. Este el primer estudio en Argentina que presenta microsatélites candidatos para E. contortisiliquum y P. dubium, que podrían ayudar en la caracterización del germoplasma.The habit fragmentation is a global reality, and very present in the Atlantic Forest. Among the species vulnerable and / or threatened by habitat fragmentation, in the Atlantic Forest, we can mention Peltophorum dubium (Cañafistula) and Enterolobium contortisiliquum (Timbó), which particularly in Misiones, are among the most interest for the forest industry, considered as well as, multipurpose species. However, a sustainable use of these species depends on the management of the diversity of tree species present in landscapes and the genetic variation within them. In Argentina, there is no information about the genetic quality correlated with the phenotypic characteristics of these species. In this sense, microsatellites are very useful tools to study genetic diversity and the structure of populations. The aim of the present work was to achieve the inter- specific amplification of microsatellite regions in E. contortisiliquum, using primers designed for E. cyclocarpum, and in P. dubium, using primers designed for Koompassia malaccensis. The obtained results confirmed the transferability of the primers used for E. contortisiliquum and P. dubium, amplifying microsatellites of the species under study for Argentina ecosystem.This being the first report in Argentina, which presents microsatellite candidates for E. contortisiliquum and P. dubium, which could help in germplasm characterization.Fil: Niella, Fernando Omar. Universidad Nacional de Misiones; ArgentinaFil: Rocha, Sandra Patricia. Universidad Nacional de Misiones; ArgentinaFil: Ojeda, Paola. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; ArgentinaFil: Petruszynski, Guido Andrés. Universidad Nacional de Misiones; ArgentinaFil: Zapata, Pedro Dario. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Otegui, Monica Beatriz. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; ArgentinaEscuela Agrotécnica Eldorado2017-12info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/82394Niella, Fernando Omar; Rocha, Sandra Patricia; Ojeda, Paola; Petruszynski, Guido Andrés; Zapata, Pedro Dario; et al.; Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb.; Escuela Agrotécnica Eldorado; Yvyrareta; 25; 12-2017; 60-650328-88542469-004XCONICET DigitalCONICETspainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://yvyrareta.com.ar/index.php/ediciones-anteriores/diciembre-2016-n23-2/item/71-ampli-marcad-microsatinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-10T13:14:59Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/82394instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-10 13:14:59.531CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. Amplification of microsatelite markers in peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) andenterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), using koompassia malaccensis benth. andenterolobium cyclocarpum (jacq.) griseb as primers |
title |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. |
spellingShingle |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. Niella, Fernando Omar TIMBO CAÑAFISTULA MARCADORES GENETICOS DIVERSIDAD |
title_short |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. |
title_full |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. |
title_fullStr |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. |
title_full_unstemmed |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. |
title_sort |
Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb. |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Niella, Fernando Omar Rocha, Sandra Patricia Ojeda, Paola Petruszynski, Guido Andrés Zapata, Pedro Dario Otegui, Monica Beatriz |
author |
Niella, Fernando Omar |
author_facet |
Niella, Fernando Omar Rocha, Sandra Patricia Ojeda, Paola Petruszynski, Guido Andrés Zapata, Pedro Dario Otegui, Monica Beatriz |
author_role |
author |
author2 |
Rocha, Sandra Patricia Ojeda, Paola Petruszynski, Guido Andrés Zapata, Pedro Dario Otegui, Monica Beatriz |
author2_role |
author author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
TIMBO CAÑAFISTULA MARCADORES GENETICOS DIVERSIDAD |
topic |
TIMBO CAÑAFISTULA MARCADORES GENETICOS DIVERSIDAD |
purl_subject.fl_str_mv |
https://purl.org/becyt/ford/1.7 https://purl.org/becyt/ford/1 |
dc.description.none.fl_txt_mv |
La fragmentación del hábitat es una realidad global, y muy presente en la Selva paranaense. Entre las especies vulnerables y/o amenazadas por la fragmentación del hábitat, en la Selva paranaense, podemos mencionar a Peltophorum dubium (Caña fístula) y Enterolobium contortisiliquum (Timbó), que particularmente en Misiones, se encuentran entre las de mayor interés para la industria forestal, consideradas también, como especies multipropósitos. No obstante, un uso sostenible de estas especies depende del manejo de la diversidad de especies de árboles presentes en paisajes y la variación genética dentro de estas. En Argentina no existe información acerca de la calidad genética que se conjugue con las características fenotípicas de dichas especies. En este sentido, los microsatélites son herramientas muy útiles para estudiar la diversidad genética y la estructura de las poblaciones. El objetivo del presente trabajo fue lograr la amplificación inter-específica de regiones de microsatélites de E. contortisiliquum, utilizando cebadores diseñados para E. cyclocarpum, y de P. dubium, utilizando cebadores diseñados para Koompassia malaccensis. Los resultados obtenidos confirmaron la transferibilidad de los cebadores utilizados para E. contortisiliquum y P. dubium, permitiendo amplificar regiones microsatélites de las especies estudiadas en poblaciones Argentinas. Este el primer estudio en Argentina que presenta microsatélites candidatos para E. contortisiliquum y P. dubium, que podrían ayudar en la caracterización del germoplasma. The habit fragmentation is a global reality, and very present in the Atlantic Forest. Among the species vulnerable and / or threatened by habitat fragmentation, in the Atlantic Forest, we can mention Peltophorum dubium (Cañafistula) and Enterolobium contortisiliquum (Timbó), which particularly in Misiones, are among the most interest for the forest industry, considered as well as, multipurpose species. However, a sustainable use of these species depends on the management of the diversity of tree species present in landscapes and the genetic variation within them. In Argentina, there is no information about the genetic quality correlated with the phenotypic characteristics of these species. In this sense, microsatellites are very useful tools to study genetic diversity and the structure of populations. The aim of the present work was to achieve the inter- specific amplification of microsatellite regions in E. contortisiliquum, using primers designed for E. cyclocarpum, and in P. dubium, using primers designed for Koompassia malaccensis. The obtained results confirmed the transferability of the primers used for E. contortisiliquum and P. dubium, amplifying microsatellites of the species under study for Argentina ecosystem.This being the first report in Argentina, which presents microsatellite candidates for E. contortisiliquum and P. dubium, which could help in germplasm characterization. Fil: Niella, Fernando Omar. Universidad Nacional de Misiones; Argentina Fil: Rocha, Sandra Patricia. Universidad Nacional de Misiones; Argentina Fil: Ojeda, Paola. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina Fil: Petruszynski, Guido Andrés. Universidad Nacional de Misiones; Argentina Fil: Zapata, Pedro Dario. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina Fil: Otegui, Monica Beatriz. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina |
description |
La fragmentación del hábitat es una realidad global, y muy presente en la Selva paranaense. Entre las especies vulnerables y/o amenazadas por la fragmentación del hábitat, en la Selva paranaense, podemos mencionar a Peltophorum dubium (Caña fístula) y Enterolobium contortisiliquum (Timbó), que particularmente en Misiones, se encuentran entre las de mayor interés para la industria forestal, consideradas también, como especies multipropósitos. No obstante, un uso sostenible de estas especies depende del manejo de la diversidad de especies de árboles presentes en paisajes y la variación genética dentro de estas. En Argentina no existe información acerca de la calidad genética que se conjugue con las características fenotípicas de dichas especies. En este sentido, los microsatélites son herramientas muy útiles para estudiar la diversidad genética y la estructura de las poblaciones. El objetivo del presente trabajo fue lograr la amplificación inter-específica de regiones de microsatélites de E. contortisiliquum, utilizando cebadores diseñados para E. cyclocarpum, y de P. dubium, utilizando cebadores diseñados para Koompassia malaccensis. Los resultados obtenidos confirmaron la transferibilidad de los cebadores utilizados para E. contortisiliquum y P. dubium, permitiendo amplificar regiones microsatélites de las especies estudiadas en poblaciones Argentinas. Este el primer estudio en Argentina que presenta microsatélites candidatos para E. contortisiliquum y P. dubium, que podrían ayudar en la caracterización del germoplasma. |
publishDate |
2017 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2017-12 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:ar-repo/semantics/articulo |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11336/82394 Niella, Fernando Omar; Rocha, Sandra Patricia; Ojeda, Paola; Petruszynski, Guido Andrés; Zapata, Pedro Dario; et al.; Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb.; Escuela Agrotécnica Eldorado; Yvyrareta; 25; 12-2017; 60-65 0328-8854 2469-004X CONICET Digital CONICET |
url |
http://hdl.handle.net/11336/82394 |
identifier_str_mv |
Niella, Fernando Omar; Rocha, Sandra Patricia; Ojeda, Paola; Petruszynski, Guido Andrés; Zapata, Pedro Dario; et al.; Amplificación de marcadores microsatélites en peltophorum dubium (spreng.) Taub (caña fistola) y enterolobium contortisiliquum (vell.) (timbo), utilizando cebadores de la especie koompassia malaccensis benth y enterolobium cyclocarpum (jacq.) Griseb.; Escuela Agrotécnica Eldorado; Yvyrareta; 25; 12-2017; 60-65 0328-8854 2469-004X CONICET Digital CONICET |
dc.language.none.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://yvyrareta.com.ar/index.php/ediciones-anteriores/diciembre-2016-n23-2/item/71-ampli-marcad-microsat |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/ |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Escuela Agrotécnica Eldorado |
publisher.none.fl_str_mv |
Escuela Agrotécnica Eldorado |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:CONICET Digital (CONICET) instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
reponame_str |
CONICET Digital (CONICET) |
collection |
CONICET Digital (CONICET) |
instname_str |
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.name.fl_str_mv |
CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.mail.fl_str_mv |
dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar |
_version_ |
1842980805127700480 |
score |
12.993085 |