Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication

Autores
de Borba, Luana; Villordo, Sergio; Iglesias, Nestor Gabriel; Filomatori, Claudia Veronica; Gebhard, Leopoldo German; Gamarnik, Andrea Vanesa
Año de publicación
2015
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The dengue virus genome is a dynamic molecule that adopts different conformations in the infected cell. Here, using RNA folding predictions, chemical probing analysis, RNA binding assays, and functional studies, we identified new cis-acting elements present in the capsid coding sequence that facilitate cyclization of the viral RNA by hybridization with a sequence involved in a local dumbbell structure at the viral 3' untranslated region (UTR). The identified interaction differentially enhances viral replication in mosquito and mammalian cells.
Fil: de Borba, Luana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Villordo, Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Iglesias, Nestor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Filomatori, Claudia Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gebhard, Leopoldo German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gamarnik, Andrea Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Materia
Dengue
Flavivirus
Rna-Rna Interaction
Replication
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/19659
Acceder
id CONICETDig_83214a0a724992c957f2b3da656e6c83
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/19659
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replicationde Borba, LuanaVillordo, SergioIglesias, Nestor GabrielFilomatori, Claudia VeronicaGebhard, Leopoldo GermanGamarnik, Andrea VanesaDengueFlavivirusRna-Rna InteractionReplicationhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1The dengue virus genome is a dynamic molecule that adopts different conformations in the infected cell. Here, using RNA folding predictions, chemical probing analysis, RNA binding assays, and functional studies, we identified new cis-acting elements present in the capsid coding sequence that facilitate cyclization of the viral RNA by hybridization with a sequence involved in a local dumbbell structure at the viral 3' untranslated region (UTR). The identified interaction differentially enhances viral replication in mosquito and mammalian cells.Fil: de Borba, Luana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Villordo, Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Iglesias, Nestor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Filomatori, Claudia Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Gebhard, Leopoldo German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Gamarnik, Andrea Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaAmerican Society For Microbiology2015-03info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/19659de Borba, Luana; Villordo, Sergio; Iglesias, Nestor Gabriel; Filomatori, Claudia Veronica; Gebhard, Leopoldo German; et al.; Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication; American Society For Microbiology; Journal Of Virology; 89; 6; 3-2015; 3430-34370022-538X1098-5514CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://jvi.asm.org/content/89/6/3430info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1128/JVI.02677-14info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-10T13:04:47Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/19659instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-10 13:04:48.0CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
title Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
spellingShingle Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
de Borba, Luana
Dengue
Flavivirus
Rna-Rna Interaction
Replication
title_short Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
title_full Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
title_fullStr Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
title_full_unstemmed Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
title_sort Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
dc.creator.none.fl_str_mv de Borba, Luana
Villordo, Sergio
Iglesias, Nestor Gabriel
Filomatori, Claudia Veronica
Gebhard, Leopoldo German
Gamarnik, Andrea Vanesa
author de Borba, Luana
author_facet de Borba, Luana
Villordo, Sergio
Iglesias, Nestor Gabriel
Filomatori, Claudia Veronica
Gebhard, Leopoldo German
Gamarnik, Andrea Vanesa
author_role author
author2 Villordo, Sergio
Iglesias, Nestor Gabriel
Filomatori, Claudia Veronica
Gebhard, Leopoldo German
Gamarnik, Andrea Vanesa
author2_role author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Dengue
Flavivirus
Rna-Rna Interaction
Replication
topic Dengue
Flavivirus
Rna-Rna Interaction
Replication
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv The dengue virus genome is a dynamic molecule that adopts different conformations in the infected cell. Here, using RNA folding predictions, chemical probing analysis, RNA binding assays, and functional studies, we identified new cis-acting elements present in the capsid coding sequence that facilitate cyclization of the viral RNA by hybridization with a sequence involved in a local dumbbell structure at the viral 3' untranslated region (UTR). The identified interaction differentially enhances viral replication in mosquito and mammalian cells.
Fil: de Borba, Luana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Villordo, Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Iglesias, Nestor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Filomatori, Claudia Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gebhard, Leopoldo German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gamarnik, Andrea Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
description The dengue virus genome is a dynamic molecule that adopts different conformations in the infected cell. Here, using RNA folding predictions, chemical probing analysis, RNA binding assays, and functional studies, we identified new cis-acting elements present in the capsid coding sequence that facilitate cyclization of the viral RNA by hybridization with a sequence involved in a local dumbbell structure at the viral 3' untranslated region (UTR). The identified interaction differentially enhances viral replication in mosquito and mammalian cells.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-03
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/19659
de Borba, Luana; Villordo, Sergio; Iglesias, Nestor Gabriel; Filomatori, Claudia Veronica; Gebhard, Leopoldo German; et al.; Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication; American Society For Microbiology; Journal Of Virology; 89; 6; 3-2015; 3430-3437
0022-538X
1098-5514
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/19659
identifier_str_mv de Borba, Luana; Villordo, Sergio; Iglesias, Nestor Gabriel; Filomatori, Claudia Veronica; Gebhard, Leopoldo German; et al.; Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication; American Society For Microbiology; Journal Of Virology; 89; 6; 3-2015; 3430-3437
0022-538X
1098-5514
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://jvi.asm.org/content/89/6/3430
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1128/JVI.02677-14
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv American Society For Microbiology
publisher.none.fl_str_mv American Society For Microbiology
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1842980162830860288
score 12.993085

Publicaciones similares