Identification of renin inhibitors peptides from amaranth proteins by docking protocols

Autores
Nardo, Agustina Estefania; Añon, Maria Cristina; Quiroga, Alejandra Viviana
Año de publicación
2020
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The objective of this work was to develop a new protocol to predict with greater confidence peptides as potential inhibitors of the renin enzyme. For this, free, friendly and rigorous servers developed specifically for peptides as ligands were used. Six peptides (SFNLPILR; FNLPILR; SFNLPIL; QAFEDGFEWVSFK; AFEDGFEWVSFK and VNVDDPSKA) identified in an amaranth hydrolysate obtained with alcalase (hydrolysis degree 21% ± 4) were used. Two positive (angiotensinogen and IRLIIVLMPILMA) and one negative (a tridecapeptide of alanine) controls were included in the analysis. A protocol was designed to include two consecutive stages was performed using CABS-dock server (http://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock) and FlexPepDock server (http://flexpepdock.furmanlab.cs.huji.ac.il/). Peptides SFNLPILR, FNLPILR and AFEDGFEWVSFK inhibited the enzyme in vitro. The heptapeptide FNLPILR was the most potent inhibitor, with an IC50 of 0.41 mM.
Fil: Nardo, Agustina Estefania. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos; Argentina
Fil: Añon, Maria Cristina. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos; Argentina
Fil: Quiroga, Alejandra Viviana. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos; Argentina
Materia
DOCKING
RENIN
BIOACTIVE PEPTIDE
AMARANTH
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Fil: Nardo, Agustina Estefania. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Criotecnología de Alimentos; Argentina
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