AFLP characterization of three argentine Coprotus species

Autores
Ramos, Araceli Marcela; Tadic, Luis Franco; Policelli, Nahuel; Ferreyra, Laura Ines; Cinto, Isabel Esther
Año de publicación
2015
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
AFLP methodology was applied to characterize three Coprotus species (C. lacteus, C. niveus, C. sexdecimsporus) so as to estimate the levels of polymorphism within species, to analyze the phenetic relationships among them, and to contrast the AFLP findings to those of a previous RAPD study. The high number of AFLP bands obtained with the six assayed primers allowed us to detect intra-specific variability. The genetic variability within species obtained using AFLP (measured in terms of percentage of polymorphic loci) was two to three times higher than those obtained by RAPD. The phenograms generated by AFLP markers grouped all strains of the same species into three defined clusters, and a higher association between C. lacteus and C. sexdecimsporus was also observed. The AFLP technique could become a powerful tool for genera such as Coprotus, in which a high intra-specific homogeneity does not allow detection of genetic variability using other PCR-based markers.
Fil: Ramos, Araceli Marcela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Fil: Tadic, Luis Franco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Fil: Policelli, Nahuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Fil: Ferreyra, Laura Ines. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
Fil: Cinto, Isabel Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Materia
Ascomycota
Molecular Markers
Coprophilous
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/23980
Acceder
id CONICETDig_4e70d849c65ffbec27041f36f441b8b1
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/23980
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling AFLP characterization of three argentine Coprotus speciesRamos, Araceli MarcelaTadic, Luis FrancoPolicelli, NahuelFerreyra, Laura InesCinto, Isabel EstherAscomycotaMolecular MarkersCoprophiloushttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1AFLP methodology was applied to characterize three Coprotus species (C. lacteus, C. niveus, C. sexdecimsporus) so as to estimate the levels of polymorphism within species, to analyze the phenetic relationships among them, and to contrast the AFLP findings to those of a previous RAPD study. The high number of AFLP bands obtained with the six assayed primers allowed us to detect intra-specific variability. The genetic variability within species obtained using AFLP (measured in terms of percentage of polymorphic loci) was two to three times higher than those obtained by RAPD. The phenograms generated by AFLP markers grouped all strains of the same species into three defined clusters, and a higher association between C. lacteus and C. sexdecimsporus was also observed. The AFLP technique could become a powerful tool for genera such as Coprotus, in which a high intra-specific homogeneity does not allow detection of genetic variability using other PCR-based markers.Fil: Ramos, Araceli Marcela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaFil: Tadic, Luis Franco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaFil: Policelli, Nahuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaFil: Ferreyra, Laura Ines. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; ArgentinaFil: Cinto, Isabel Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaMycotaxon2015-03info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/23980Ramos, Araceli Marcela; Tadic, Luis Franco; Policelli, Nahuel; Ferreyra, Laura Ines; Cinto, Isabel Esther; AFLP characterization of three argentine Coprotus species; Mycotaxon; Mycotaxon; 130; 1; 3-2015; 265-2730093-46662154-8889CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.ingentaconnect.com/contentone/mtax/mt/2015/00000130/00000001/art00033info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.5248/130.265info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-22T11:36:36Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/23980instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-22 11:36:36.693CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv AFLP characterization of three argentine Coprotus species
title AFLP characterization of three argentine Coprotus species
spellingShingle AFLP characterization of three argentine Coprotus species
Ramos, Araceli Marcela
Ascomycota
Molecular Markers
Coprophilous
title_short AFLP characterization of three argentine Coprotus species
title_full AFLP characterization of three argentine Coprotus species
title_fullStr AFLP characterization of three argentine Coprotus species
title_full_unstemmed AFLP characterization of three argentine Coprotus species
title_sort AFLP characterization of three argentine Coprotus species
dc.creator.none.fl_str_mv Ramos, Araceli Marcela
Tadic, Luis Franco
Policelli, Nahuel
Ferreyra, Laura Ines
Cinto, Isabel Esther
author Ramos, Araceli Marcela
author_facet Ramos, Araceli Marcela
Tadic, Luis Franco
Policelli, Nahuel
Ferreyra, Laura Ines
Cinto, Isabel Esther
author_role author
author2 Tadic, Luis Franco
Policelli, Nahuel
Ferreyra, Laura Ines
Cinto, Isabel Esther
author2_role author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Ascomycota
Molecular Markers
Coprophilous
topic Ascomycota
Molecular Markers
Coprophilous
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv AFLP methodology was applied to characterize three Coprotus species (C. lacteus, C. niveus, C. sexdecimsporus) so as to estimate the levels of polymorphism within species, to analyze the phenetic relationships among them, and to contrast the AFLP findings to those of a previous RAPD study. The high number of AFLP bands obtained with the six assayed primers allowed us to detect intra-specific variability. The genetic variability within species obtained using AFLP (measured in terms of percentage of polymorphic loci) was two to three times higher than those obtained by RAPD. The phenograms generated by AFLP markers grouped all strains of the same species into three defined clusters, and a higher association between C. lacteus and C. sexdecimsporus was also observed. The AFLP technique could become a powerful tool for genera such as Coprotus, in which a high intra-specific homogeneity does not allow detection of genetic variability using other PCR-based markers.
Fil: Ramos, Araceli Marcela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Fil: Tadic, Luis Franco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Fil: Policelli, Nahuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
Fil: Ferreyra, Laura Ines. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
Fil: Cinto, Isabel Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
description AFLP methodology was applied to characterize three Coprotus species (C. lacteus, C. niveus, C. sexdecimsporus) so as to estimate the levels of polymorphism within species, to analyze the phenetic relationships among them, and to contrast the AFLP findings to those of a previous RAPD study. The high number of AFLP bands obtained with the six assayed primers allowed us to detect intra-specific variability. The genetic variability within species obtained using AFLP (measured in terms of percentage of polymorphic loci) was two to three times higher than those obtained by RAPD. The phenograms generated by AFLP markers grouped all strains of the same species into three defined clusters, and a higher association between C. lacteus and C. sexdecimsporus was also observed. The AFLP technique could become a powerful tool for genera such as Coprotus, in which a high intra-specific homogeneity does not allow detection of genetic variability using other PCR-based markers.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-03
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/23980
Ramos, Araceli Marcela; Tadic, Luis Franco; Policelli, Nahuel; Ferreyra, Laura Ines; Cinto, Isabel Esther; AFLP characterization of three argentine Coprotus species; Mycotaxon; Mycotaxon; 130; 1; 3-2015; 265-273
0093-4666
2154-8889
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/23980
identifier_str_mv Ramos, Araceli Marcela; Tadic, Luis Franco; Policelli, Nahuel; Ferreyra, Laura Ines; Cinto, Isabel Esther; AFLP characterization of three argentine Coprotus species; Mycotaxon; Mycotaxon; 130; 1; 3-2015; 265-273
0093-4666
2154-8889
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.ingentaconnect.com/contentone/mtax/mt/2015/00000130/00000001/art00033
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.5248/130.265
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Mycotaxon
publisher.none.fl_str_mv Mycotaxon
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846782008455331840
score 12.982451

Publicaciones similares