Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America

Autores
Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; Gottlieb, Alexandra Marina
Año de publicación
2015
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series.
Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Font, Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
Fil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Materia
Cacti
Issr
Plastid Intergenic Spacers
Phylogenetic Analysis
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/19824

id CONICETDig_42d4e011155598d8f3e2190af2518ae9
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/19824
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South AmericaRealini, Maria FlorenciaGonzález, Graciela EstherFont, FabiánPicca, Pablo IgnacioPoggio, LidiaGottlieb, Alexandra MarinaCactiIssrPlastid Intergenic SpacersPhylogenetic Analysishttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1https://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series.Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: Font, Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; ArgentinaFil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; ArgentinaFil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaSpringer Wien2015-04info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/19824Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; et al.; Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America; Springer Wien; Plant Systematics and Evolution; 301; 4; 4-2015; 1123-11340378-26972199-6881CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00606-014-1154-1info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00606-014-1154-1info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-15T14:27:54Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/19824instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-15 14:27:54.94CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
title Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
spellingShingle Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
Realini, Maria Florencia
Cacti
Issr
Plastid Intergenic Spacers
Phylogenetic Analysis
title_short Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
title_full Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
title_fullStr Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
title_full_unstemmed Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
title_sort Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
dc.creator.none.fl_str_mv Realini, Maria Florencia
González, Graciela Esther
Font, Fabián
Picca, Pablo Ignacio
Poggio, Lidia
Gottlieb, Alexandra Marina
author Realini, Maria Florencia
author_facet Realini, Maria Florencia
González, Graciela Esther
Font, Fabián
Picca, Pablo Ignacio
Poggio, Lidia
Gottlieb, Alexandra Marina
author_role author
author2 González, Graciela Esther
Font, Fabián
Picca, Pablo Ignacio
Poggio, Lidia
Gottlieb, Alexandra Marina
author2_role author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Cacti
Issr
Plastid Intergenic Spacers
Phylogenetic Analysis
topic Cacti
Issr
Plastid Intergenic Spacers
Phylogenetic Analysis
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series.
Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Font, Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
Fil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
description The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-04
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/19824
Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; et al.; Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America; Springer Wien; Plant Systematics and Evolution; 301; 4; 4-2015; 1123-1134
0378-2697
2199-6881
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/19824
identifier_str_mv Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; et al.; Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America; Springer Wien; Plant Systematics and Evolution; 301; 4; 4-2015; 1123-1134
0378-2697
2199-6881
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00606-014-1154-1
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00606-014-1154-1
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Springer Wien
publisher.none.fl_str_mv Springer Wien
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846082738884444160
score 13.22299