Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America
- Autores
- Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; Gottlieb, Alexandra Marina
- Año de publicación
- 2015
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series.
Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Font, Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
Fil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina - Materia
-
Cacti
Issr
Plastid Intergenic Spacers
Phylogenetic Analysis - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
- Repositorio
- Institución
- Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- OAI Identificador
- oai:ri.conicet.gov.ar:11336/19824
Ver los metadatos del registro completo
id |
CONICETDig_42d4e011155598d8f3e2190af2518ae9 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/19824 |
network_acronym_str |
CONICETDig |
repository_id_str |
3498 |
network_name_str |
CONICET Digital (CONICET) |
spelling |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South AmericaRealini, Maria FlorenciaGonzález, Graciela EstherFont, FabiánPicca, Pablo IgnacioPoggio, LidiaGottlieb, Alexandra MarinaCactiIssrPlastid Intergenic SpacersPhylogenetic Analysishttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1https://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series.Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: Font, Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; ArgentinaFil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; ArgentinaFil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaFil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaSpringer Wien2015-04info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/19824Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; et al.; Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America; Springer Wien; Plant Systematics and Evolution; 301; 4; 4-2015; 1123-11340378-26972199-6881CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00606-014-1154-1info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00606-014-1154-1info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-15T14:27:54Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/19824instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-15 14:27:54.94CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
title |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
spellingShingle |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America Realini, Maria Florencia Cacti Issr Plastid Intergenic Spacers Phylogenetic Analysis |
title_short |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
title_full |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
title_fullStr |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
title_full_unstemmed |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
title_sort |
Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Realini, Maria Florencia González, Graciela Esther Font, Fabián Picca, Pablo Ignacio Poggio, Lidia Gottlieb, Alexandra Marina |
author |
Realini, Maria Florencia |
author_facet |
Realini, Maria Florencia González, Graciela Esther Font, Fabián Picca, Pablo Ignacio Poggio, Lidia Gottlieb, Alexandra Marina |
author_role |
author |
author2 |
González, Graciela Esther Font, Fabián Picca, Pablo Ignacio Poggio, Lidia Gottlieb, Alexandra Marina |
author2_role |
author author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
Cacti Issr Plastid Intergenic Spacers Phylogenetic Analysis |
topic |
Cacti Issr Plastid Intergenic Spacers Phylogenetic Analysis |
purl_subject.fl_str_mv |
https://purl.org/becyt/ford/1.6 https://purl.org/becyt/ford/1 https://purl.org/becyt/ford/1.6 https://purl.org/becyt/ford/1 |
dc.description.none.fl_txt_mv |
The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series. Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina Fil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina Fil: Font, Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina Fil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina Fil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina |
description |
The patterns of relationships between species of Opuntia from southern South America are scarcely known in spite of the importance of this region as a diversification center for the Cactaceae. This paper contributes to the better understanding of the genetic and phylogenetic relationships of 15 Opuntia species from Argentina, Bolivia, Brazil, Paraguay, and Uruguay by generating new genetic data through Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) genotyping and the sequencing of plastid intergenic spacers trnL-trnF and psbJ-petA. The species surveyed are: O. anacantha, O. arechavaletae, O. aurantiaca, O. bonaerensis, O. colubrina, O. discolor, O. elata, O. megapotamica, O. monacantha, O. penicilligera, O. quimilo, O. salmiana, O. schickendantzii, O. sulphurea, and O. ventanensis. The genetic distance-based analysis of 110 ISSR bands, applying the Neighbor-Joining and NeighborNet algorithms, evidenced considerable intraspecific variation in O. aurantiaca, O. elata, O. discolor, and O. salmiana. The emergent clustering pattern and the species assignment to taxonomic series show a general agreement for Armatae and Aurantiacae. The phylogenetic relationships were investigated via haplotype network and maximum likelihood approaches, within a broader sampling that involves most species currently accepted for South America, and samples from throughout the American continent. Hence, 15 haplotypes are recognized for southern South American opuntias whereas eight haplotypes are established for Northern Hemisphere opuntias. Biparentally and maternally inherited genetic data yield partially consistent results, giving genetic support for morphologically defined taxonomic series. |
publishDate |
2015 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2015-04 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:ar-repo/semantics/articulo |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11336/19824 Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; et al.; Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America; Springer Wien; Plant Systematics and Evolution; 301; 4; 4-2015; 1123-1134 0378-2697 2199-6881 CONICET Digital CONICET |
url |
http://hdl.handle.net/11336/19824 |
identifier_str_mv |
Realini, Maria Florencia; González, Graciela Esther; Font, Fabián; Picca, Pablo Ignacio; Poggio, Lidia; et al.; Phylogenetic relationships in Opuntia (Cactaceae, Opuntioideae) from southern South America; Springer Wien; Plant Systematics and Evolution; 301; 4; 4-2015; 1123-1134 0378-2697 2199-6881 CONICET Digital CONICET |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00606-014-1154-1 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00606-014-1154-1 |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/ |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Springer Wien |
publisher.none.fl_str_mv |
Springer Wien |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:CONICET Digital (CONICET) instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
reponame_str |
CONICET Digital (CONICET) |
collection |
CONICET Digital (CONICET) |
instname_str |
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.name.fl_str_mv |
CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.mail.fl_str_mv |
dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar |
_version_ |
1846082738884444160 |
score |
13.22299 |