Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina

Autores
Realini, Maria Florencia; Poggio, Lidia; Cámara Hernández, Julián Alberto; González, Graciela Esther
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Variation in genome size and knob heterochromatin content was explored in relationship to altitudinal cline and length of the vegetative cycle in northern Argentina, USA and Mexico landraces. It was considering that the decrease in DNA and heterochromatin content could be an adaptation to a shorter growing season and the result of artificial selection by man. Guaraní landraces from Northeastern Argentina (NEA) show similar variation in genome size (3.81pg to 7.56pg) and knob heterochromatin content than maize growing across an altitudinal cline. The present analysis offers an overview of the genetic variability of NEA maize to explain why Guaraní landraces and those along an altitudinal cline share this similar variation. Karyotype and flow cytometry data were employed. The DNA content of Guaraní landraces which lacking B chromosomes, showed no significant relationship with knob heterochromatin, suggesting differences in the amount of interspersed DNA. A significant positive relationship was found between the length of the vegetative cycle and both number and percentage of knob heterochromatin. No significant correlation was found between genome size and vegetative cycle. All these results allow us to conclude that the variation in heterochromatin content among Guaraní maize is driven by the selection of farmers for flowering time.
La variación observada en el tamaño del genoma y el contenido de heterocromatina knob en relación con el cline altitudinal y la duración del ciclo vegetativo en razas de maíz nativas del norte de Argentina, Estados Unidos y México, permitió considerar que la disminución del contenido de ADN y heterocromatina se debería a una adaptación a temporadas cortas de crecimiento y al resultado de selección artificial por parte del hombre. Las razas Guaraníes nativas del noreste de Argentina (NEA), cultivadas a bajas altitudes y sin cromosomas B, muestran una variación similar en el tamaño del genoma (3.81 pg a 7.56 pg) y el contenido de heterocromatina knob a aquellos maíces que crecen a lo largo de un cline altitudinal. El presente análisis ofrece una visión general de la variabilidad genética del maíz del NEA y trata de responder por qué estas razas Guaraníes y los maíces que crecen en un cline altitudinal presentan la variación mencionada. Se emplearon datos de cariotipo y citometría de flujo. El contenido de ADN de las razas Guaraníes no mostró correlación significativa con la heterocromatina knob, lo que sugiere diferencias en el contenido de ADN repetitivo disperso. Se encontró una correlación positiva significativa entre la duración del ciclo vegetativo tanto con el número como con el porcentaje de heterocromatina knob. No se encontró una relación significativa entre el tamaño del genoma y el ciclo vegetativo. Estos resultados nos permiten concluir que la variación en el contenido de heterocromatina entre los maíces Guaraníes estaría impulsada por la selección del tiempo de floración realizada por los agricultores.
Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; Argentina
Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; Argentina
Fil: Cámara Hernández, Julián Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Recursos Naturales y Ambiente. Cátedra de Botánica Agrícola; Argentina
Fil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; Argentina
Materia
GENOME SIZE
KNOB HETEROCHROMATIN
LENGTH OF VEGETATIVE CYCLE
REPETITIVE SEQUENCE VARIATION
SELECTIVE EFFECT
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/181638

id CONICETDig_3cd74caa0e4110056859d2e1f0c8426b
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/181638
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern ArgentinaRealini, Maria FlorenciaPoggio, LidiaCámara Hernández, Julián AlbertoGonzález, Graciela EstherGENOME SIZEKNOB HETEROCHROMATINLENGTH OF VEGETATIVE CYCLEREPETITIVE SEQUENCE VARIATIONSELECTIVE EFFECThttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1Variation in genome size and knob heterochromatin content was explored in relationship to altitudinal cline and length of the vegetative cycle in northern Argentina, USA and Mexico landraces. It was considering that the decrease in DNA and heterochromatin content could be an adaptation to a shorter growing season and the result of artificial selection by man. Guaraní landraces from Northeastern Argentina (NEA) show similar variation in genome size (3.81pg to 7.56pg) and knob heterochromatin content than maize growing across an altitudinal cline. The present analysis offers an overview of the genetic variability of NEA maize to explain why Guaraní landraces and those along an altitudinal cline share this similar variation. Karyotype and flow cytometry data were employed. The DNA content of Guaraní landraces which lacking B chromosomes, showed no significant relationship with knob heterochromatin, suggesting differences in the amount of interspersed DNA. A significant positive relationship was found between the length of the vegetative cycle and both number and percentage of knob heterochromatin. No significant correlation was found between genome size and vegetative cycle. All these results allow us to conclude that the variation in heterochromatin content among Guaraní maize is driven by the selection of farmers for flowering time.La variación observada en el tamaño del genoma y el contenido de heterocromatina knob en relación con el cline altitudinal y la duración del ciclo vegetativo en razas de maíz nativas del norte de Argentina, Estados Unidos y México, permitió considerar que la disminución del contenido de ADN y heterocromatina se debería a una adaptación a temporadas cortas de crecimiento y al resultado de selección artificial por parte del hombre. Las razas Guaraníes nativas del noreste de Argentina (NEA), cultivadas a bajas altitudes y sin cromosomas B, muestran una variación similar en el tamaño del genoma (3.81 pg a 7.56 pg) y el contenido de heterocromatina knob a aquellos maíces que crecen a lo largo de un cline altitudinal. El presente análisis ofrece una visión general de la variabilidad genética del maíz del NEA y trata de responder por qué estas razas Guaraníes y los maíces que crecen en un cline altitudinal presentan la variación mencionada. Se emplearon datos de cariotipo y citometría de flujo. El contenido de ADN de las razas Guaraníes no mostró correlación significativa con la heterocromatina knob, lo que sugiere diferencias en el contenido de ADN repetitivo disperso. Se encontró una correlación positiva significativa entre la duración del ciclo vegetativo tanto con el número como con el porcentaje de heterocromatina knob. No se encontró una relación significativa entre el tamaño del genoma y el ciclo vegetativo. Estos resultados nos permiten concluir que la variación en el contenido de heterocromatina entre los maíces Guaraníes estaría impulsada por la selección del tiempo de floración realizada por los agricultores.Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; ArgentinaFil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; ArgentinaFil: Cámara Hernández, Julián Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Recursos Naturales y Ambiente. Cátedra de Botánica Agrícola; ArgentinaFil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; ArgentinaInstituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro2021-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/181638Realini, Maria Florencia; Poggio, Lidia; Cámara Hernández, Julián Alberto; González, Graciela Esther; Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina; Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro; Rodriguésia; 72; 1-2021; 1-70370-6583CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.scielo.br/j/rod/a/NgbLMtDhQB5RPY8CcGLDhpL/?lang=eninfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1590/2175-7860202172004info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-22T12:00:24Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/181638instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-22 12:00:24.643CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
title Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
spellingShingle Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
Realini, Maria Florencia
GENOME SIZE
KNOB HETEROCHROMATIN
LENGTH OF VEGETATIVE CYCLE
REPETITIVE SEQUENCE VARIATION
SELECTIVE EFFECT
title_short Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
title_full Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
title_fullStr Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
title_full_unstemmed Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
title_sort Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina
dc.creator.none.fl_str_mv Realini, Maria Florencia
Poggio, Lidia
Cámara Hernández, Julián Alberto
González, Graciela Esther
author Realini, Maria Florencia
author_facet Realini, Maria Florencia
Poggio, Lidia
Cámara Hernández, Julián Alberto
González, Graciela Esther
author_role author
author2 Poggio, Lidia
Cámara Hernández, Julián Alberto
González, Graciela Esther
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv GENOME SIZE
KNOB HETEROCHROMATIN
LENGTH OF VEGETATIVE CYCLE
REPETITIVE SEQUENCE VARIATION
SELECTIVE EFFECT
topic GENOME SIZE
KNOB HETEROCHROMATIN
LENGTH OF VEGETATIVE CYCLE
REPETITIVE SEQUENCE VARIATION
SELECTIVE EFFECT
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv Variation in genome size and knob heterochromatin content was explored in relationship to altitudinal cline and length of the vegetative cycle in northern Argentina, USA and Mexico landraces. It was considering that the decrease in DNA and heterochromatin content could be an adaptation to a shorter growing season and the result of artificial selection by man. Guaraní landraces from Northeastern Argentina (NEA) show similar variation in genome size (3.81pg to 7.56pg) and knob heterochromatin content than maize growing across an altitudinal cline. The present analysis offers an overview of the genetic variability of NEA maize to explain why Guaraní landraces and those along an altitudinal cline share this similar variation. Karyotype and flow cytometry data were employed. The DNA content of Guaraní landraces which lacking B chromosomes, showed no significant relationship with knob heterochromatin, suggesting differences in the amount of interspersed DNA. A significant positive relationship was found between the length of the vegetative cycle and both number and percentage of knob heterochromatin. No significant correlation was found between genome size and vegetative cycle. All these results allow us to conclude that the variation in heterochromatin content among Guaraní maize is driven by the selection of farmers for flowering time.
La variación observada en el tamaño del genoma y el contenido de heterocromatina knob en relación con el cline altitudinal y la duración del ciclo vegetativo en razas de maíz nativas del norte de Argentina, Estados Unidos y México, permitió considerar que la disminución del contenido de ADN y heterocromatina se debería a una adaptación a temporadas cortas de crecimiento y al resultado de selección artificial por parte del hombre. Las razas Guaraníes nativas del noreste de Argentina (NEA), cultivadas a bajas altitudes y sin cromosomas B, muestran una variación similar en el tamaño del genoma (3.81 pg a 7.56 pg) y el contenido de heterocromatina knob a aquellos maíces que crecen a lo largo de un cline altitudinal. El presente análisis ofrece una visión general de la variabilidad genética del maíz del NEA y trata de responder por qué estas razas Guaraníes y los maíces que crecen en un cline altitudinal presentan la variación mencionada. Se emplearon datos de cariotipo y citometría de flujo. El contenido de ADN de las razas Guaraníes no mostró correlación significativa con la heterocromatina knob, lo que sugiere diferencias en el contenido de ADN repetitivo disperso. Se encontró una correlación positiva significativa entre la duración del ciclo vegetativo tanto con el número como con el porcentaje de heterocromatina knob. No se encontró una relación significativa entre el tamaño del genoma y el ciclo vegetativo. Estos resultados nos permiten concluir que la variación en el contenido de heterocromatina entre los maíces Guaraníes estaría impulsada por la selección del tiempo de floración realizada por los agricultores.
Fil: Realini, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; Argentina
Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; Argentina
Fil: Cámara Hernández, Julián Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Recursos Naturales y Ambiente. Cátedra de Botánica Agrícola; Argentina
Fil: González, Graciela Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Laboratorio de Citogenética y Evolución; Argentina
description Variation in genome size and knob heterochromatin content was explored in relationship to altitudinal cline and length of the vegetative cycle in northern Argentina, USA and Mexico landraces. It was considering that the decrease in DNA and heterochromatin content could be an adaptation to a shorter growing season and the result of artificial selection by man. Guaraní landraces from Northeastern Argentina (NEA) show similar variation in genome size (3.81pg to 7.56pg) and knob heterochromatin content than maize growing across an altitudinal cline. The present analysis offers an overview of the genetic variability of NEA maize to explain why Guaraní landraces and those along an altitudinal cline share this similar variation. Karyotype and flow cytometry data were employed. The DNA content of Guaraní landraces which lacking B chromosomes, showed no significant relationship with knob heterochromatin, suggesting differences in the amount of interspersed DNA. A significant positive relationship was found between the length of the vegetative cycle and both number and percentage of knob heterochromatin. No significant correlation was found between genome size and vegetative cycle. All these results allow us to conclude that the variation in heterochromatin content among Guaraní maize is driven by the selection of farmers for flowering time.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-01
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/181638
Realini, Maria Florencia; Poggio, Lidia; Cámara Hernández, Julián Alberto; González, Graciela Esther; Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina; Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro; Rodriguésia; 72; 1-2021; 1-7
0370-6583
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/181638
identifier_str_mv Realini, Maria Florencia; Poggio, Lidia; Cámara Hernández, Julián Alberto; González, Graciela Esther; Genome size and repetitive sequences are driven by artificial selection on the length of the vegetative cycle in maize landraces from Northeastern Argentina; Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro; Rodriguésia; 72; 1-2021; 1-7
0370-6583
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.scielo.br/j/rod/a/NgbLMtDhQB5RPY8CcGLDhpL/?lang=en
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1590/2175-7860202172004
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro
publisher.none.fl_str_mv Instituto de Pesquisas Jardim Botanico do Rio de Janeiro
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846782330352435200
score 12.982451