Different mutation rates in the basal core promoter and precore regions between hepatitis B virus subgenotype F1b clusters

Autores
Martinez, Micaela; Elizalde, Maria Mercedes; Giadans, Cecilia Graciela; Monzani, María Cecilia; Campos, Rodolfo Hector; Flichman, Diego Martin
Año de publicación
2023
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Hepatitis B virus (HBV) is the main etiological agent of hepatocellular carcinoma (HCC) worldwide. It has been classified into nine genotypes and several subgenotypes, with uneven global distribution. There is growing evidence that the viral genotype influences the course and outcome of chronic hepatitis B infection. Two evolutionarily different clusters of the subgenotype F1b, called basal and cosmopolitan, have been described. The two clusters have constrained geographical distribution, with the particular feature that the basal cluster is present in regions of high HCC incidence, while the Cosmopolitan cluster is found in regions of low HCC incidence. The BCP/pC region was sequenced in 68 cases chronically infected with the F1b subgenotype to determine if there was a differential pattern of pathogenic-associated mutations between both clusters. Twenty-two of the 68 cases belonged to the subgenotype F1b basal cluster and 46 to the cosmopolitan cluster. Among the HBeAg-negative patients the A1762T/G1764A and G1896A mutations were more frequently found in the basal samples (85.7 and 92.9%) compared to the cosmopolitan ones (50 and 18.2%). Interestingly, no HBeAg loss-associated mutations were observed in 7.1 and 36.4% of the basal and cosmopolitan cases, respectively. The different rate of mutations associated with a more severe course of chronic hepatitis in the basal cluster would support the difference in the HCC incidence rate in the geographical regions where the basal cluster is restricted.
Fil: Martinez, Micaela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina
Fil: Elizalde, Maria Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina
Fil: Giadans, Cecilia Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina
Fil: Monzani, María Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina
Fil: Campos, Rodolfo Hector. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina
Fil: Flichman, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina
Materia
BASAL CORE PROMOTER
HEPATITIS B VIRUS
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Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
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Institución
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The two clusters have constrained geographical distribution, with the particular feature that the basal cluster is present in regions of high HCC incidence, while the Cosmopolitan cluster is found in regions of low HCC incidence. The BCP/pC region was sequenced in 68 cases chronically infected with the F1b subgenotype to determine if there was a differential pattern of pathogenic-associated mutations between both clusters. Twenty-two of the 68 cases belonged to the subgenotype F1b basal cluster and 46 to the cosmopolitan cluster. Among the HBeAg-negative patients the A1762T/G1764A and G1896A mutations were more frequently found in the basal samples (85.7 and 92.9%) compared to the cosmopolitan ones (50 and 18.2%). Interestingly, no HBeAg loss-associated mutations were observed in 7.1 and 36.4% of the basal and cosmopolitan cases, respectively. The different rate of mutations associated with a more severe course of chronic hepatitis in the basal cluster would support the difference in the HCC incidence rate in the geographical regions where the basal cluster is restricted.Fil: Martinez, Micaela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; ArgentinaFil: Elizalde, Maria Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; ArgentinaFil: Giadans, Cecilia Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Monzani, María Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; ArgentinaFil: Campos, Rodolfo Hector. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; ArgentinaFil: Flichman, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; ArgentinaWiley Blackwell Publishing, Inc2023-06info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/227792Martinez, Micaela; Elizalde, Maria Mercedes; Giadans, Cecilia Graciela; Monzani, María Cecilia; Campos, Rodolfo Hector; et al.; Different mutation rates in the basal core promoter and precore regions between hepatitis B virus subgenotype F1b clusters; Wiley Blackwell Publishing, Inc; Journal Of Viral Hepatitis.; 30; 6; 6-2023; 540-5431352-0504CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jvh.13822info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1111/jvh.13822info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:00:27Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/227792instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:00:27.548CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
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