Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic

Autores
Alonso, María Pía; Fernandez Iriarte, Pedro Jose
Año de publicación
2015
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Durante el Pleistoceno se registraron en Sudamérica importantes cambios climáticos relacionados con ciclos de glaciaciones que probablemente han tenido efectos significativos en la historia evolutiva de muchas especies marinas. Para evaluar el patrón de demografía histórica y la estructura genético poblacional de la pescadilla de red (Cynoscion guatucupa) se analizó una secuencia de 401 pb del Citocromo b del ADN mitocondrial de 92 individuos de tres áreas costeras en Argentina y una de Brasil en el Atlántico sudoccidental. La diversidad haplotípica fue alta y la diversidad nucleotídica fue baja para todos los sitios de muestreo. La topología en forma de estrella en base a los haplotipos mitocondriales muestra un patrón no estructurado geográficamente en concordancia con el análisis de AMOVA. El test de Fu fue negativo y altamente significativo, mientras que el análisis de mismatch distribution produjo una distribución unimodal, indicando expansión poblacional. La tasa de mutación del Citocromo b, calibrada a partir de la comparación de la divergencia entre especies del género Cynoscion encontrados en ambos lados del Istmo de Panamá fue estimada en 0,006 sustituciones por millón de años. Para datar el cambio del tamaño poblacional a través del tiempo se usó Bayesian Skyline Plot estimando un tiempo a la coalescencia de 155.000 años. Cynoscion guatucupa mostró un patrón de acumulación de mutaciones asociado a un rápido crecimiento poblacional luego de un cuello de botella, probablemente relacionado con un evento de cambio climático ocurrido en el Pleistoceno medio-tardío.
In South America, the Pleistocene was characterized by important environmental changes related to glacial cycles, which had significant effects on the evolutionary history of several marine species. To evaluate the pattern of demographic history and the genetic structure of striped weakfish Cynoscion guatucupa, a 401 bp fragment of the mitochondrial Cytochrome b gene was sequenced from 92 individuals from three coastal areas in Argentina and one in Brazil in the southwestern Atlantic. Haplotype diversity was high, whereas nucleotide diversity was low among all sampling sites. The star-like pattern was not phylogeographically structured, in agreement with the AMOVA analysis. The Fu’s test was negative and highly significant whereas the mismatch analysis yielded an unimodal distribution indicating population expansion. The mutation rate of Cytochrome b, calibrated with pairs of species of Cynoscion found on both sides of the Isthmus of Panama was estimated at 0.006 substitutions per million years. The Bayesian skyline plot was used to date changes in population size through time and revealed a coalescence time of 155,000 years. Cynoscion guatucupa exhibited a mutation accumulation pattern associated with a rapid population growth after a period of low effective population size, probably linked to climatic changes in the late Pleistocene.
Fil: Alonso, María Pía. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Fernandez Iriarte, Pedro Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencia Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
Materia
Genetic Structure
Cytochrome B
Marine Fish
Pleistocene
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/50596

id CONICETDig_2b355aae73f6b5d85223997c94d37d19
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/50596
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlanticEstructura genética e historia demográfica de la pescadilla de red Cynoscion guatucupa (sciaenidae) del atlántico sudoccidentalAlonso, María PíaFernandez Iriarte, Pedro JoseGenetic StructureCytochrome BMarine FishPleistocenehttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1Durante el Pleistoceno se registraron en Sudamérica importantes cambios climáticos relacionados con ciclos de glaciaciones que probablemente han tenido efectos significativos en la historia evolutiva de muchas especies marinas. Para evaluar el patrón de demografía histórica y la estructura genético poblacional de la pescadilla de red (Cynoscion guatucupa) se analizó una secuencia de 401 pb del Citocromo b del ADN mitocondrial de 92 individuos de tres áreas costeras en Argentina y una de Brasil en el Atlántico sudoccidental. La diversidad haplotípica fue alta y la diversidad nucleotídica fue baja para todos los sitios de muestreo. La topología en forma de estrella en base a los haplotipos mitocondriales muestra un patrón no estructurado geográficamente en concordancia con el análisis de AMOVA. El test de Fu fue negativo y altamente significativo, mientras que el análisis de mismatch distribution produjo una distribución unimodal, indicando expansión poblacional. La tasa de mutación del Citocromo b, calibrada a partir de la comparación de la divergencia entre especies del género Cynoscion encontrados en ambos lados del Istmo de Panamá fue estimada en 0,006 sustituciones por millón de años. Para datar el cambio del tamaño poblacional a través del tiempo se usó Bayesian Skyline Plot estimando un tiempo a la coalescencia de 155.000 años. Cynoscion guatucupa mostró un patrón de acumulación de mutaciones asociado a un rápido crecimiento poblacional luego de un cuello de botella, probablemente relacionado con un evento de cambio climático ocurrido en el Pleistoceno medio-tardío.In South America, the Pleistocene was characterized by important environmental changes related to glacial cycles, which had significant effects on the evolutionary history of several marine species. To evaluate the pattern of demographic history and the genetic structure of striped weakfish Cynoscion guatucupa, a 401 bp fragment of the mitochondrial Cytochrome b gene was sequenced from 92 individuals from three coastal areas in Argentina and one in Brazil in the southwestern Atlantic. Haplotype diversity was high, whereas nucleotide diversity was low among all sampling sites. The star-like pattern was not phylogeographically structured, in agreement with the AMOVA analysis. The Fu’s test was negative and highly significant whereas the mismatch analysis yielded an unimodal distribution indicating population expansion. The mutation rate of Cytochrome b, calibrated with pairs of species of Cynoscion found on both sides of the Isthmus of Panama was estimated at 0.006 substitutions per million years. The Bayesian skyline plot was used to date changes in population size through time and revealed a coalescence time of 155,000 years. Cynoscion guatucupa exhibited a mutation accumulation pattern associated with a rapid population growth after a period of low effective population size, probably linked to climatic changes in the late Pleistocene.Fil: Alonso, María Pía. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fernandez Iriarte, Pedro Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencia Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaSociedad Argentina de Genética2015-12info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/50596Alonso, María Pía; Fernandez Iriarte, Pedro Jose; Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic; Sociedad Argentina de Genética; Basic and Applied Genetics; 26; 2; 12-2015; 7-151666-03901852-6233CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://ref.scielo.org/xwxgrrinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T09:38:10Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/50596instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 09:38:10.726CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
Estructura genética e historia demográfica de la pescadilla de red Cynoscion guatucupa (sciaenidae) del atlántico sudoccidental
title Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
spellingShingle Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
Alonso, María Pía
Genetic Structure
Cytochrome B
Marine Fish
Pleistocene
title_short Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
title_full Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
title_fullStr Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
title_full_unstemmed Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
title_sort Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic
dc.creator.none.fl_str_mv Alonso, María Pía
Fernandez Iriarte, Pedro Jose
author Alonso, María Pía
author_facet Alonso, María Pía
Fernandez Iriarte, Pedro Jose
author_role author
author2 Fernandez Iriarte, Pedro Jose
author2_role author
dc.subject.none.fl_str_mv Genetic Structure
Cytochrome B
Marine Fish
Pleistocene
topic Genetic Structure
Cytochrome B
Marine Fish
Pleistocene
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv Durante el Pleistoceno se registraron en Sudamérica importantes cambios climáticos relacionados con ciclos de glaciaciones que probablemente han tenido efectos significativos en la historia evolutiva de muchas especies marinas. Para evaluar el patrón de demografía histórica y la estructura genético poblacional de la pescadilla de red (Cynoscion guatucupa) se analizó una secuencia de 401 pb del Citocromo b del ADN mitocondrial de 92 individuos de tres áreas costeras en Argentina y una de Brasil en el Atlántico sudoccidental. La diversidad haplotípica fue alta y la diversidad nucleotídica fue baja para todos los sitios de muestreo. La topología en forma de estrella en base a los haplotipos mitocondriales muestra un patrón no estructurado geográficamente en concordancia con el análisis de AMOVA. El test de Fu fue negativo y altamente significativo, mientras que el análisis de mismatch distribution produjo una distribución unimodal, indicando expansión poblacional. La tasa de mutación del Citocromo b, calibrada a partir de la comparación de la divergencia entre especies del género Cynoscion encontrados en ambos lados del Istmo de Panamá fue estimada en 0,006 sustituciones por millón de años. Para datar el cambio del tamaño poblacional a través del tiempo se usó Bayesian Skyline Plot estimando un tiempo a la coalescencia de 155.000 años. Cynoscion guatucupa mostró un patrón de acumulación de mutaciones asociado a un rápido crecimiento poblacional luego de un cuello de botella, probablemente relacionado con un evento de cambio climático ocurrido en el Pleistoceno medio-tardío.
In South America, the Pleistocene was characterized by important environmental changes related to glacial cycles, which had significant effects on the evolutionary history of several marine species. To evaluate the pattern of demographic history and the genetic structure of striped weakfish Cynoscion guatucupa, a 401 bp fragment of the mitochondrial Cytochrome b gene was sequenced from 92 individuals from three coastal areas in Argentina and one in Brazil in the southwestern Atlantic. Haplotype diversity was high, whereas nucleotide diversity was low among all sampling sites. The star-like pattern was not phylogeographically structured, in agreement with the AMOVA analysis. The Fu’s test was negative and highly significant whereas the mismatch analysis yielded an unimodal distribution indicating population expansion. The mutation rate of Cytochrome b, calibrated with pairs of species of Cynoscion found on both sides of the Isthmus of Panama was estimated at 0.006 substitutions per million years. The Bayesian skyline plot was used to date changes in population size through time and revealed a coalescence time of 155,000 years. Cynoscion guatucupa exhibited a mutation accumulation pattern associated with a rapid population growth after a period of low effective population size, probably linked to climatic changes in the late Pleistocene.
Fil: Alonso, María Pía. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Fernandez Iriarte, Pedro Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencia Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
description Durante el Pleistoceno se registraron en Sudamérica importantes cambios climáticos relacionados con ciclos de glaciaciones que probablemente han tenido efectos significativos en la historia evolutiva de muchas especies marinas. Para evaluar el patrón de demografía histórica y la estructura genético poblacional de la pescadilla de red (Cynoscion guatucupa) se analizó una secuencia de 401 pb del Citocromo b del ADN mitocondrial de 92 individuos de tres áreas costeras en Argentina y una de Brasil en el Atlántico sudoccidental. La diversidad haplotípica fue alta y la diversidad nucleotídica fue baja para todos los sitios de muestreo. La topología en forma de estrella en base a los haplotipos mitocondriales muestra un patrón no estructurado geográficamente en concordancia con el análisis de AMOVA. El test de Fu fue negativo y altamente significativo, mientras que el análisis de mismatch distribution produjo una distribución unimodal, indicando expansión poblacional. La tasa de mutación del Citocromo b, calibrada a partir de la comparación de la divergencia entre especies del género Cynoscion encontrados en ambos lados del Istmo de Panamá fue estimada en 0,006 sustituciones por millón de años. Para datar el cambio del tamaño poblacional a través del tiempo se usó Bayesian Skyline Plot estimando un tiempo a la coalescencia de 155.000 años. Cynoscion guatucupa mostró un patrón de acumulación de mutaciones asociado a un rápido crecimiento poblacional luego de un cuello de botella, probablemente relacionado con un evento de cambio climático ocurrido en el Pleistoceno medio-tardío.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-12
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/50596
Alonso, María Pía; Fernandez Iriarte, Pedro Jose; Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic; Sociedad Argentina de Genética; Basic and Applied Genetics; 26; 2; 12-2015; 7-15
1666-0390
1852-6233
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/50596
identifier_str_mv Alonso, María Pía; Fernandez Iriarte, Pedro Jose; Genetic structure and demographic history of striped weakfish Cynoscion guatucupa (sciaenidae) from the southwestern atlantic; Sociedad Argentina de Genética; Basic and Applied Genetics; 26; 2; 12-2015; 7-15
1666-0390
1852-6233
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://ref.scielo.org/xwxgrr
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedad Argentina de Genética
publisher.none.fl_str_mv Sociedad Argentina de Genética
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844613206342893568
score 13.070432