Insect-specific RNA viruses detection in Field-Caught Aedes aegypti mosquitoes from Argentina using NGS technology

Autores
Ripoll, Lucas; Iserte, Javier Alonso; Cerrudo, Carolina Susana; Presti, Damián Ariel; Serrat, José Humberto; Poma, Hugo Ramiro; Mangione, Federico Alejandro Javier; Micheloud, Gabriela Analía; Gioria, Verónica Viviana; Berrón, Clara Inés; Zago, María Paola; Borio, Cristina Silvia; Bilen, Marcos Fabian
Año de publicación
2025
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Mosquitoes are the primary vectors of arthropod-borne pathogens. Aedes aegypti is one of the most widespread mosquito species worldwide, responsible for transmitting diseases such as Dengue, Zika, and Chikungunya, among other medically significant viruses. Characterizing the array of viruses circulating in mosquitoes, particularly in Aedes aegypti, is a crucial tool for detecting and developing novel strategies to prevent arbovirus outbreaks. In this study, we address the implementation of a sequencing and analysis pipeline based on the Oxford Nanopore Technologies MinION Mk1b system, for arboviral detection in field-caught mosquitoes from Argentina. Full genome of Humaita Tubiacanga Virus (HTV), Phasi Charoen-like Phasivirus (PCLV), Aedes aegypti totivirus (AaeTV) has been sequenced in three distinct regions of Argentina comprising Buenos Aires province, Santa Fe province and the northern province of Salta. Viral sequences enriched by SISPA and coupled with Nanopore sequencing can be a useful tool for viral surveillance, not only for detecting viruses that have a high impact on human and animal health, but also for detecting insect-specific viruses that could promote the transmission of arboviruses.
Fil: Ripoll, Lucas. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Iserte, Javier Alonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
Fil: Cerrudo, Carolina Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina
Fil: Presti, Damián Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina
Fil: Serrat, José Humberto. Unidad de Conocimiento Traslacional Hospitalario ; Hospital Publico Materno Infantil ; Gobierno de la Provincia de Salta;
Fil: Poma, Hugo Ramiro. Gobierno de la Provincia de Salta. Hospital Publico Materno Infantil.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones para la Industria Química. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones para la Industria Química; Argentina
Fil: Mangione, Federico Alejandro Javier. Gobierno de la Provincia de Salta. Hospital Publico Materno Infantil.; Argentina
Fil: Micheloud, Gabriela Analía. Universidad Nacional del Litoral; Argentina
Fil: Gioria, Verónica Viviana. Universidad Nacional del Litoral; Argentina
Fil: Berrón, Clara Inés. Universidad Nacional del Litoral; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe; Argentina
Fil: Zago, María Paola. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Provincia de Salta. Hospital Publico Materno Infantil.; Argentina
Fil: Borio, Cristina Silvia. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Bilen, Marcos Fabian. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Materia
NGS
AEDES
METAVIROMICA
VIROMICA
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
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In this study, we address the implementation of a sequencing and analysis pipeline based on the Oxford Nanopore Technologies MinION Mk1b system, for arboviral detection in field-caught mosquitoes from Argentina. Full genome of Humaita Tubiacanga Virus (HTV), Phasi Charoen-like Phasivirus (PCLV), Aedes aegypti totivirus (AaeTV) has been sequenced in three distinct regions of Argentina comprising Buenos Aires province, Santa Fe province and the northern province of Salta. Viral sequences enriched by SISPA and coupled with Nanopore sequencing can be a useful tool for viral surveillance, not only for detecting viruses that have a high impact on human and animal health, but also for detecting insect-specific viruses that could promote the transmission of arboviruses.Fil: Ripoll, Lucas. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Iserte, Javier Alonso. 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