El secretoma estimado del hongo fitopatógeno Stemphylium lycopersici CIDEFI-216

Autores
Franco, Mario Emilio Ernesto; López, Silvina Marianela Yanil; Medina, Rocío; Troncozo , María Inés; Lucentini, César Gustavo; Saparrat, Mario; Balatti, Pedro Alberto
Año de publicación
2017
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
El secretoma es el conjunto de proteínas exportadas por una célula. El estudio del secretoma de fitopatógenos es clave porque muchos efectores que modulan la interacción planta-patógeno son de naturaleza proteica. El objetivo del trabajo fue caracterizar el secretoma in silico del hongo fitopatógeno Stemphylium lycopersici CIDEFI-216. Este se predijo por la presencia en el proteoma teórico (GenBank: LGLR00000000.1) de péptidos señal de localización extracelu-lar y ausencia de dominios transmembranales (SignalP 4.1). Se evaluó el contenido de enzimas activas sobre carbohidratos o CAZymes (dbCAN), peptidasas y sus inhibidores (MEROPS), lipasas y otras hidrolasas de éster carboxílico (LED) y efectores (EffectorP, PHI-base). Se en-contró que S. lycopersici CIDEFI-216 tiene el potencial de secretar 1005 proteínas, incluyendo 356 CAZymes, 121 peptidasas, 9 inhibidores de peptidasas, 134 hidrolasas de éster carboxílico y 440 efectores. Estos datos son básicos para futuros estudios del secretoma in planta por el método de la huella peptídica.
Publicado en el Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, volumen 52 suplemento
Materia
Biología Celular, Microbiología
Secretoma
Stemphylium lycopersici
Biocontrol
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Repositorio
CIC Digital (CICBA)
Institución
Comisión de Investigaciones Científicas de la Provincia de Buenos Aires
OAI Identificador
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