Estudios sobre los mecanismos de desnudamiento y encapsidación del virus del dengue

• Autores: Byk, Laura Andrea
• Año de publicación: 2016
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: tesis doctoral
• Colaborador/a o director/a de tesis: Gamarnik, Andrea Vanesa
• Materia: DENGUE; FLAVIVIRUS; CAPSIDE; DESNUDAMIENTO; ENCAPSIDACION; INTERACCION VIRUS-CELULA; DENGUE; FLAVIVIRUS; CAPSID; UNCOATING; ENCAPSIDATION; VIRUS-HOST INTERACTION
• Institución: Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

El virus del dengue es un importante y creciente problema de salud pública en todo el mundo, dejando a aproximadamente la mitad de la población mundial en riesgo de infección. En la actualidad no se encuentran disponibles antivirales ni vacunas efectivas. En esta tesis se estudiaron los procesos de encapsidación y desnudamiento del virus del dengue, con el foco puesto en la proteína de cápside. Se identificaron requerimientos de residuos básicos en la zona de la α4 de cápside, detallando la necesidad de una densidad de carga positiva en la zona, así como también residuos básicos en posiciones puntuales. Esto permitió proponer un modelo en el cual tanto la región N-terminal desestructurada como la zona C-terminal contribuirían al compactado del genoma viral. Por otro lado, se identificaron por primera vez PTMs en la proteína de cápside de dengue. La presencia de distinto tipo de modificaciones en cápside aislada de células o partículas virales podría indicar una selección de la proteína que se encapsida. Por último, se estudió el mecanismo de desnudamiento de dengue y se demostró que la liberación al citoplasma del genoma que entra dentro de la partícula viral depende de la maquinaria de ubiquitinación, pero no de la actividad del proteasoma, poniendo en evidencia un paso vulnerable para el desarrollo de estrategias antivirales.
Dengue virus is a major and growing public health problem worldwide, leaving about half of the world's population at risk of infection. At present there are no effective antivirals or vaccines available. In this work, dengue virus encapsidation and uncoating processes were studied, with the focus on capsid protein. The requirements of basic residues in the α4 region of capsid were investigated, detailing the need for a positive charge density in the area, as well as basic residues in specific positions. This allowed us to elaborate a model in which both the unstructured N-terminal as well as the C-terminal region would contribute to viral genome compaction. Furthermore, post-translational modifications in DENV capsid protein were identified for the first time. The presence of different types of modifications in capsid isolated from cells or viral particles could indicate a selection of the protein that is encapsidated. Finally, dengue virus uncoating was regarded. We found that ubiquitination, but not proteasome activity, is crucial for dengue RNA release into the cytoplasm from incoming virions, highlighting a vulnerable step for the development of antivirals.
Fil: Byk, Laura Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.