Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos

Autores
Ré, Miguel Angel
Año de publicación
2011
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
El proceso de traslocación de polímeros a través de biomembranas es un problema de gran importancia en una variedad de procesos biológicos. Transporte de proteínas a través de membranas celulares, de ARN a través de membranas nucleares, transporte de macromoléculas en distribución de fármacos o transferencia de genes en biotecnología son ejemplos de este tipo de procesos. El proceso de traslocación, en sus distintas manifestaciones, es complejo debido a la flexibilidad que presentan las cadenas y las fluctuaciones del medio. Se presenta en esta comunicación un modelo para la traslocación de polímeros, inspirado en un método propuesto para secuenciación de ADN, basado en el esquema de Caminatas Aleatorias de Tiempo Continuo. Se incluye una dinámica que reproduce el comportamiento no exponencial a tiempos largos para la distribución de tiempos de traslocación observado en esta técnica de secuenciación y se analiza el efecto del sesgo en el desplazamiento
The process of polymer translocation through biomembranes is a problem of great importance in a diversity of biological functions. Proteins transport through cellular membranes, RNA across nuclear membranes, macromolecules in drug delivery or genes transferences in biotechnology are examples of this kind of processes. The translocation process, in its different instances, is highly complex due to conformational changes and chain flexibility. It is presented in this communication a model for polymer translocation, motivated by experimental data in a proposed method for DNA sequencing. The model is based on Continuous Time Random Walk schema. It is included a trapping dynamic that can reproduce non exponential behaviour at long times in the translocation time distribution, which has been reported in the sequencing technique
Fil: Ré, Miguel Angel. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Córdoba (UTN-FRC). Córdoba. Argentina
Fuente
An. (Asoc. Fís. Argent., En línea) 2011;02(23):35-41
Materia
TRASLOCACION
NANOPOROS
ANOMALO
PRIMER PASAJE
CAMINATA AL AZAR
TRASLOCATION
NANOPORES
ANOMALOUS
RANDOM WALK
FIRST PASSAGE TIME
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
Repositorio
Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
Institución
Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
OAI Identificador
afa:afa_v23_n02_p035

id BDUBAFCEN_1860bb9873e8826a60fb29a7ae1579f9
oai_identifier_str afa:afa_v23_n02_p035
network_acronym_str BDUBAFCEN
repository_id_str 1896
network_name_str Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
spelling Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporosModel for polymer translocation through nanoporesRé, Miguel AngelTRASLOCACIONNANOPOROSANOMALOPRIMER PASAJECAMINATA AL AZARTRASLOCATIONNANOPORESANOMALOUSRANDOM WALKFIRST PASSAGE TIMEEl proceso de traslocación de polímeros a través de biomembranas es un problema de gran importancia en una variedad de procesos biológicos. Transporte de proteínas a través de membranas celulares, de ARN a través de membranas nucleares, transporte de macromoléculas en distribución de fármacos o transferencia de genes en biotecnología son ejemplos de este tipo de procesos. El proceso de traslocación, en sus distintas manifestaciones, es complejo debido a la flexibilidad que presentan las cadenas y las fluctuaciones del medio. Se presenta en esta comunicación un modelo para la traslocación de polímeros, inspirado en un método propuesto para secuenciación de ADN, basado en el esquema de Caminatas Aleatorias de Tiempo Continuo. Se incluye una dinámica que reproduce el comportamiento no exponencial a tiempos largos para la distribución de tiempos de traslocación observado en esta técnica de secuenciación y se analiza el efecto del sesgo en el desplazamientoThe process of polymer translocation through biomembranes is a problem of great importance in a diversity of biological functions. Proteins transport through cellular membranes, RNA across nuclear membranes, macromolecules in drug delivery or genes transferences in biotechnology are examples of this kind of processes. The translocation process, in its different instances, is highly complex due to conformational changes and chain flexibility. It is presented in this communication a model for polymer translocation, motivated by experimental data in a proposed method for DNA sequencing. The model is based on Continuous Time Random Walk schema. It is included a trapping dynamic that can reproduce non exponential behaviour at long times in the translocation time distribution, which has been reported in the sequencing techniqueFil: Ré, Miguel Angel. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Córdoba (UTN-FRC). Córdoba. ArgentinaAsociación Física Argentina2011info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/20.500.12110/afa_v23_n02_p035An. (Asoc. Fís. Argent., En línea) 2011;02(23):35-41reponame:Biblioteca Digital (UBA-FCEN)instname:Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturalesinstacron:UBA-FCENspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar2025-10-23T11:16:03Zafa:afa_v23_n02_p035Institucionalhttps://digital.bl.fcen.uba.ar/Universidad públicaNo correspondehttps://digital.bl.fcen.uba.ar/cgi-bin/oaiserver.cgiana@bl.fcen.uba.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:18962025-10-23 11:16:04.953Biblioteca Digital (UBA-FCEN) - Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturalesfalse
dc.title.none.fl_str_mv Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
Model for polymer translocation through nanopores
title Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
spellingShingle Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
Ré, Miguel Angel
TRASLOCACION
NANOPOROS
ANOMALO
PRIMER PASAJE
CAMINATA AL AZAR
TRASLOCATION
NANOPORES
ANOMALOUS
RANDOM WALK
FIRST PASSAGE TIME
title_short Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
title_full Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
title_fullStr Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
title_full_unstemmed Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
title_sort Modelo para traslocación de polímeros a través de nanoporos
dc.creator.none.fl_str_mv Ré, Miguel Angel
author Ré, Miguel Angel
author_facet Ré, Miguel Angel
author_role author
dc.subject.none.fl_str_mv TRASLOCACION
NANOPOROS
ANOMALO
PRIMER PASAJE
CAMINATA AL AZAR
TRASLOCATION
NANOPORES
ANOMALOUS
RANDOM WALK
FIRST PASSAGE TIME
topic TRASLOCACION
NANOPOROS
ANOMALO
PRIMER PASAJE
CAMINATA AL AZAR
TRASLOCATION
NANOPORES
ANOMALOUS
RANDOM WALK
FIRST PASSAGE TIME
dc.description.none.fl_txt_mv El proceso de traslocación de polímeros a través de biomembranas es un problema de gran importancia en una variedad de procesos biológicos. Transporte de proteínas a través de membranas celulares, de ARN a través de membranas nucleares, transporte de macromoléculas en distribución de fármacos o transferencia de genes en biotecnología son ejemplos de este tipo de procesos. El proceso de traslocación, en sus distintas manifestaciones, es complejo debido a la flexibilidad que presentan las cadenas y las fluctuaciones del medio. Se presenta en esta comunicación un modelo para la traslocación de polímeros, inspirado en un método propuesto para secuenciación de ADN, basado en el esquema de Caminatas Aleatorias de Tiempo Continuo. Se incluye una dinámica que reproduce el comportamiento no exponencial a tiempos largos para la distribución de tiempos de traslocación observado en esta técnica de secuenciación y se analiza el efecto del sesgo en el desplazamiento
The process of polymer translocation through biomembranes is a problem of great importance in a diversity of biological functions. Proteins transport through cellular membranes, RNA across nuclear membranes, macromolecules in drug delivery or genes transferences in biotechnology are examples of this kind of processes. The translocation process, in its different instances, is highly complex due to conformational changes and chain flexibility. It is presented in this communication a model for polymer translocation, motivated by experimental data in a proposed method for DNA sequencing. The model is based on Continuous Time Random Walk schema. It is included a trapping dynamic that can reproduce non exponential behaviour at long times in the translocation time distribution, which has been reported in the sequencing technique
Fil: Ré, Miguel Angel. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Regional Córdoba (UTN-FRC). Córdoba. Argentina
description El proceso de traslocación de polímeros a través de biomembranas es un problema de gran importancia en una variedad de procesos biológicos. Transporte de proteínas a través de membranas celulares, de ARN a través de membranas nucleares, transporte de macromoléculas en distribución de fármacos o transferencia de genes en biotecnología son ejemplos de este tipo de procesos. El proceso de traslocación, en sus distintas manifestaciones, es complejo debido a la flexibilidad que presentan las cadenas y las fluctuaciones del medio. Se presenta en esta comunicación un modelo para la traslocación de polímeros, inspirado en un método propuesto para secuenciación de ADN, basado en el esquema de Caminatas Aleatorias de Tiempo Continuo. Se incluye una dinámica que reproduce el comportamiento no exponencial a tiempos largos para la distribución de tiempos de traslocación observado en esta técnica de secuenciación y se analiza el efecto del sesgo en el desplazamiento
publishDate 2011
dc.date.none.fl_str_mv 2011
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12110/afa_v23_n02_p035
url https://hdl.handle.net/20.500.12110/afa_v23_n02_p035
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Asociación Física Argentina
publisher.none.fl_str_mv Asociación Física Argentina
dc.source.none.fl_str_mv An. (Asoc. Fís. Argent., En línea) 2011;02(23):35-41
reponame:Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
instname:Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
instacron:UBA-FCEN
reponame_str Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
collection Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
instname_str Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
instacron_str UBA-FCEN
institution UBA-FCEN
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital (UBA-FCEN) - Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
repository.mail.fl_str_mv ana@bl.fcen.uba.ar
_version_ 1846784833737457664
score 12.982451