Clasificación por enterotipos y grupos ortólogos del microbioma humano con métodos no supervisados

Authors
Santa María, Cristóbal; Santa María, Victoria; Ávila, Laura; Otaegui, Juan Carlos; Soria, Marcelo A.
Publication Year
2016
Language
Spanish
Format
conference paper
Status
Published version
Description
Se relatan las tareas llevadas a cabo por el Grupo de Investigación y Desarrollo en Data Mining del Departamento de Ingeniería e Investigaciones Tecnológicas de la UNLAM durante el año 2015 en el marco del Proyecto de Incentivos C169 “Aplicaciones de Data Mining al Estudio del Microbioma Humano”. Se detallan las pruebas realizadas con el software SUPERFOCUS y la base de datos genéticos SEED, para desarrollar los análisis taxonómicos y funcionales que prepararan la información de las secuencias microbiómicas para procesarla con algoritmos de data mining. Se explicitan los aspectos teóricos y prácticos de la aplicación de estos algoritmos sobre conjuntos de prueba. Se analiza la interpretación clínica dada a los resultados y finalmente se describen los cursos de acción para continuar con la investigación durante 2016.
Eje: Bases de Datos y Minería de Datos
Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI)
Subject
Ciencias Informáticas
ADN
Minería de Datos
microbioma
Access level
Open access
License
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5 Argentina (CC BY-NC-SA 2.5)
Repository
SEDICI (UNLP)
Institution
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identifier
oai:sedici.unlp.edu.ar:10915/52846