Diversity of arbuscular mycorrhizal fungi in soil from the Pampa Ondulada, Argentina, assesed by pyrosequencing and traditional techniques

Authors
Colombo, Roxana; Fernandez Bidondo, Laura; Silvani, Vanesa Analia; Carbonetto, María Belén; Rascovan, N.; Bompadre, Maria Josefina; Pergola, Mariana; Cuenca, G.; Godeas, Alicia Margarita
Publication Year
2014
Language
English
Format
article
Status
Published version
Description
The aim of this study was to assess the effects of agronomic practices on arbuscular mycorrhizal (AM) fungal community in soils from the Pampa Ondulada region (Argentina), and to compare conclusions reached when using pyrosequencing or morphological approach. AM fungal diversity was assessed in three agricultural exploitations located at the Pampa Ondulada region (Argentina) by 454 amplicon pyrosequencing and morphological (based on spore traits) approaches. Two kinds of soil managements are found in these sites (agronomic and non-agronomic). 188 Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs) and 29 morphological species of AM fungi were identified in total. Non effect of soil management on AM richness was detected. AM fungal communities were more diverse and equitable in absence of agronomic management. In contrast, results on beta diversity varied according to the methodology used. We concluded that agronomic management of soil has a negative effect on AM fungal community biodiversity in the Pampa Ondulada region. We also conclude that both methodologies complement each other in the study of AM fungal ecology. This study greatly improved the knowledge about AM fungi in South America where the molecular diversity of AM fungi was practically unknown.
Fil: Colombo, Roxana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Cs.exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental. Laboratorio de Microbiología del Suelo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Fernandez Bidondo, Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Cs.exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental. Laboratorio de Microbiología del Suelo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Silvani, Vanesa Analia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Cs.exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental. Laboratorio de Microbiología del Suelo; Argentina
Fil: Carbonetto, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
Fil: Rascovan, N.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
Fil: Bompadre, Maria Josefina. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Pergola, Mariana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Cs.exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental. Laboratorio de Microbiología del Suelo; Argentina
Fil: Cuenca, G.. Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas; Venezuela
Fil: Godeas, Alicia Margarita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Cs.exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental. Laboratorio de Microbiología del Suelo; Argentina
Subject
GLOMEROMYCOTA
AGROECOSYSTEM
BIODIVERSITY
PYROSEQUENCING TECHNOLOGY
MORPHOTYPING TAXONOMY
Otras Ciencias Biológicas
Ciencias Biológicas
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
Access level
Restricted access
License
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repository
CONICET Digital (CONICET)
Institution
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identifier
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/31485