Genotyping Mycobacterium bovis from cattle in the Central Pampas of Argentina: temporal and regional trends

• Authors: Shimizu, Ernesto; Macías, Analía; Paolicchi, Fernando Alberto; Magnano, Gabriel; Zapata, Laura; Fernández, Analía; Canal, Ana; Garbaccio, Sergio; Cataldi, Ángel Adrián; Caimi, Karina Cynthia; Zumárraga, Martín José
• Publication Year: 2014
• Language: English
• Format: article
• Status: Published version
• Description: Mycobacterium bovis is the causative agent of bovine tuberculosis (TB), a disease that affects approximately 5% of Argentinean cattle. Among the molecular methods for genotyping, the most convenient are spoligotyping and variable number of tandem repeats (VNTR). A total of 378 samples from bovines with visible lesions consistent with TB were collected at slaughterhouses in three provinces, yielding 265 M. bovisspoligotyped isolates, which were distributed into 35 spoligotypes. In addition, 197 isolates were also typed by the VNTR method and 54 combined VNTR types were detected. There were 24 clusters and 27 orphan types. When both typing methods were combined, 98 spoligotypes and VNTR types were observed with 27 clusters and 71 orphan types. By performing a meta-analysis with previous spoligotyping results, we identified regional and temporal trends in the population structure of M. bovis. For SB0140, the most predominant spoligotype in Argentina, the prevalence percentage remained high during different periods, varying from 25.5-57.8% (1994-2011). By contrast, the second and third most prevalent spoligotypes exhibited important fluctuations. This study shows that there has been an expansion in ancestral lineages as demonstrated by spoligotyping. However, exact tandem repeat typing suggests dynamic changes in the clonal population of this microorganism.; Fil: Shimizu, Ernesto. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; Argentina; Fil: Macías, Analía. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentina; Fil: Paolicchi, Fernando Alberto. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; Argentina; Fil: Magnano, Gabriel. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentina; Fil: Zapata, Laura. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentina; Fil: Fernández, Analía. Provincia de Entre Ríos. Secretaría de Producción. Dirección General de Producción Animal; Argentina; Fil: Canal, Ana. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina; Fil: Garbaccio, Sergio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias Castelar. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Patobiología; Argentina; Fil: Cataldi, Ángel Adrián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias Castelar. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina; Fil: Caimi, Karina Cynthia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias Castelar. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina; Fil: Zumárraga, Martín José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias Castelar. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
• Subject: Bovine TB; Mycobacterium bovis; Spoligotype; VNTRs; Otras Ciencias Veterinarias; Ciencias Veterinarias; CIENCIAS AGRÍCOLAS
• Access level: Open access
• License: https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
• Institution: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
• OAI Identifier: oai:ri.conicet.gov.ar:11336/33394