Trypanosoma cruzi I haplogroups in american countries based on spliced leader-intergenic spacer polimorphism

Authors
Cura, Carolina Inés; Mejía Jaramillo, Ana M.; Duffy, Tomás; Burgos, Juan Miguel; Rodriguero, Marcela Silvina; Cardinal, Marta Victoria; Kjos, Sonia; Gurgel Gonçalves, Rodrigo; Blanchet, Denis; De Pablos, Luis M.; Tomasini, Nicolás; da Silva, Alexandre; Russomando, Graciela Mabel; Cuba, Cesar A. Cuba; Aznar, Christine; Abate, Teresa; Levin, Mariano Jorge; Osuna, Antonio; Gurtler, Ricardo Esteban; Diosque, Patricio; Solari, Aldo; Triana Chávez, Omar; Schijman, Alejandro Gabriel
Publication Year
2010
Language
English
Format
article
Status
Published version
Description
The intergenic region of spliced-leader (SL-IR) genes from 105 Trypanosoma cruzi I (Tc I) infected biological samples, culture isolates and stocks from 11 endemic countries, from Argentina to the USA were characterised, allowing identification of 76 genotypes with 54 polymorphic sites from 123 aligned sequences. On the basis of the microsatellite motif proposed by Herrera et al. (2007) to define four haplotypes in Colombia, we could classify these genotypes into four distinct Tc I SL-IR groups, three corresponding to the former haplotypes Ia (11 genotypes), Ib (11 genotypes) and Id (35 genotypes); and one novel group, Ie (19 genotypes). Genotypes harbouring the Tc Ic motif were not detected in our study. Tc Ia was associated with domestic cycles in southern and northern South America and sylvatic cycles in Central and North America. Tc Ib was found in all transmission cycles from Colombia. Tc Id was identified in all transmission cycles from Argentina and Colombia, including Chagas cardiomyopathy patients, sylvatic Brazilian samples and human cases from French Guiana, Panama and Venezuela. Tc Ie gathered five samples from domestic Triatoma infestans from northern Argentina, nine samples from wild Mepraia spinolai and Mepraia gajardoi and two chagasic patients from Chile and one from a Bolivian patient with chagasic reactivation. Mixed infections by Tc Ia. +. Tc Id, Tc Ia. +. Tc Ie and Tc Id. +. Tc Ie were detected in vector faeces and isolates from human and vector samples. In addition, Tc Ia and Tc Id were identified in different tissues from a heart transplanted Chagas cardiomyopathy patient with reactivation, denoting histotropism. Trypanosoma cruzi I SL-IR genotypes from parasites infecting Triatoma gerstaeckeri and Didelphis virginiana from USA, T. infestans from Paraguay, Rhodnius nasutus and Rhodnius neglectus from Brazil and M. spinolai and M. gajardoi from Chile are to our knowledge described for the first time.
Fil: Cura, Carolina Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Mejía Jaramillo, Ana M.. Universidad de Antioquia; Colombia
Fil: Duffy, Tomás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Burgos, Juan Miguel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Rodriguero, Marcela Silvina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Cardinal, Marta Victoria. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
Fil: Kjos, Sonia. Centers for Disease Control and Prevention; Estados Unidos
Fil: Gurgel Gonçalves, Rodrigo. Universidade do Brasília; Brasil
Fil: Blanchet, Denis. Universite Des Antilles Et de la Guyane; Guayana Francesa
Fil: De Pablos, Luis M.. Universidad de Granada; España
Fil: Tomasini, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; Argentina
Fil: da Silva, Alexandre. Centers for Disease Control and Prevention; Estados Unidos
Fil: Russomando, Graciela Mabel. Universidad Nacional de Asunción. Rectorado. Instituto de Investigaciones En Cs. de la Salud; Paraguay
Fil: Cuba, Cesar A. Cuba. Universidade do Brasília; Brasil
Fil: Aznar, Christine. Universite Des Antilles Et de la Guyane; Guayana Francesa
Fil: Abate, Teresa. Universidad Central de Venezuela. Facultad de Medicina; Venezuela
Fil: Levin, Mariano Jorge. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Osuna, Antonio. Universidad de Granada; España
Fil: Gurtler, Ricardo Esteban. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
Fil: Diosque, Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; Argentina
Fil: Solari, Aldo. Facultad de Medicina de la Universidad de Chile; Chile
Fil: Triana Chávez, Omar. Universidad de Antioquia; Colombia
Fil: Schijman, Alejandro Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Subject
CHAGAS DISEASE
DISCRETE TYPING UNIT
GENOTYPE
PCR
SPLICED-LEADER INTERGENIC REGION
TRYPANOSOMA CRUZI I
Otras Ciencias Biológicas
Ciencias Biológicas
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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Open access
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