Enhanced IRES activity by the 3'UTR element determines the virulence of FMDV isolates

Authors
García Núñez, María Soledad; Gismondi, Maria Ines; König, Guido Alberto; Berinstein, Analía; Taboga, Oscar Alberto; Rieder, Elizabeth; Martínez Salas, Encarnación; Carrillo, Elisa Cristina
Publication Year
2014
Language
English
Format
article
Status
Published version
Description
A reverse genetics approach was used to identify viral genetic determinants of the differential virulence displayed by two field foot-and-mouth disease virus (FMDV) strains (A/Arg/00 and A/Arg/01) isolated in Argentina during the 2000-2001 epidemics. A molecular clone of A/Arg/01 strain and viral chimeras containing the S-fragment or the internal ribosome entry site (IRES) of A/Arg/00 in the A/Arg/01 backbone were constructed and characterized. The IRES appeared as a determining factor of the lower level of A/Arg/00 replication in cell culture. High-throughput RNA probing revealed structural differences between both IRESs. Translation experiments using either synthetic viral RNAs ( in vitro) or bicistronic plasmids ( in vivo) showed that these IRESs' activities differ when the viral 3' untranslated region (UTR) is present, suggesting that their function is differentially modulated by this region. This work provides experimental evidence supporting the role of the IRES-3'UTR modulation in determining the level of FMDV replication in field strains.
Fil: García Núñez, María Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Gismondi, Maria Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: König, Guido Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Berinstein, Analía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Taboga, Oscar Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Rieder, Elizabeth. Plum Island Animal Disease Center; Estados Unidos. United States Department of Agriculture. Agricultural Research Service; Argentina
Fil: Martínez Salas, Encarnación. Universidad Autónoma de Madrid. Centro de Biología Molecular; España. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España
Fil: Carrillo, Elisa Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Subject
3'UTR
FMDV
HSHAPE
INFECTIOUS CDNA CLONE
IRES
RNA STRUCTURE
VIRULENCE
Otras Biotecnología Agropecuaria
Biotecnología Agropecuaria
CIENCIAS AGRÍCOLAS
Access level
Restricted access
License
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repository
CONICET Digital (CONICET)
Institution
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identifier
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/85577