A whole genome bioinformatic approach to determine potential latent phase specific targets in Mycobacterium tuberculosis

Authors
Defelipe, Lucas Alfredo; Fernández Do Porto, Darío Augusto; Pereira Ramos, Pablo Ivan; Nicolás, Marisa Fabiana; Sosa, Ezequiel; Radusky, Leandro Gabriel; Lanzarotti, Esteban Omar; Turjanski, Adrian; Marti, Marcelo Adrian
Publication Year
2016
Language
English
Format
article
Status
Published version
Description
Current Tuberculosis treatment is long and expensive, faces the increasing burden of MDR/XDR strains and lack of effective treatment against latent form, resulting in an urgent need of new anti-TB drugs. Key to TB biology is its capacity to fight the host's RNOS mediated attack. RNOS are known to display a concentration dependent mycobactericidal activity, which leads to the following hypothesis "if we know which proteins are targeted by RNOS and kill TB, we we might be able to inhibit them with drugs resulting in a synergistic bactericidal effect". Based on this idea, we performed an Mtb metabolic network whole proteome analysis of potential RNOS sensitive and relevant targets which includes target druggability and essentiality criteria. Our results, available at http://tuberq.proteinq.com.ar yield new potential TB targets, like I3PS, while also providing and updated view of previous proposals becoming an important tool for researchers looking for new ways of killing TB.
Fil: Defelipe, Lucas Alfredo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina
Fil: Fernández Do Porto, Darío Augusto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Pereira Ramos, Pablo Ivan. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz; Brasil. Laboratorio Nacional de Computaçao Cientí­fica; Brasil
Fil: Nicolás, Marisa Fabiana. Laboratorio Nacional de Computaçao Cientí­fica; Brasil
Fil: Sosa, Ezequiel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Radusky, Leandro Gabriel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Lanzarotti, Esteban Omar. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Turjanski, Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
Fil: Marti, Marcelo Adrian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
Subject
LATENT PHASE
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
REACTIVE OXYGEN AND NITROGEN SPECIES (RNOS)
STRUCTURAL BIOINFORMATICS
Ciencias de la Computación
Ciencias de la Computación e Información
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
Access level
Restricted access
License
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repository
CONICET Digital (CONICET)
Institution
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identifier
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/39652